2019 |
| Kanovei V., Lyubetsky V., Factoring Solovay-random extensions, with application to the Reduction property.
Monatshefte fur Mathematik, 2019, submitted. WoS Q2 |
| Kanovei V., Lyubetsky V., The full basis theorem does not imply analytic wellordering,
Annals of pure and applied logic, 2019, submitted. WoS Q1 |
| Kanovei V., Lyubetsky V., Canonization of smooth equivalence relations on infinite-dimensional E0-large products.
Notre Dame J. Form. Logic, 2019, принято в печать. SCIMAGO, Q2. |
| Kanovei V., Lyubetsky V., Non-uniformizable sets with countable cross-sections on a given level of the projective hierarchy.
Fundamenta mathematicae, 2019, 245, 2, pp. 175--216. DOI: 10.4064/fm517-7-2018 SCOPUS, Q2 http://iitp.ru/https://www.doi.org/10.4064/fm517-7-2018 |
| Кановей В.Г., Любецкий В.А., Определимые элементы борелевских множеств.
Математические заметки, 2019, 105, вып. 5, стр. 696–707. SCIMAGO Q2 http://mi.mathnet.ru/mz12001 |
| Kanovei V., Lyubetsky V., Borel OD sets of reals are OD-Borel in some simple models.
Proceedings of the American mathematical society, 2019, 147, no 3, pp. 1277–1282. DOI 10.1090/proc/14286 WoS Q2 SCIMAGO Q1 http://iitp.ru/https://doi.org/10.1090/proc/14286 |
| Kanovei V., Lyubetsky V., Definable minimal collapse functions at arbitrary projective levels.
Journal of Symbolic Logic, 2019, vol. 84, no 1, pp. 266-289. DOI:10.1017/jsl.2018.77 WoS Q1 http://iitp.ru/https://doi.org/10.1017/jsl.2018.77 |
2018 |
| Kanovei V., Lyubetsky V., On intermediate extensions of generic extensions by a random real.
arXiv:1811.10568 [math.LO], December 2018 http://iitp.ru/https://arxiv.org/abs/1811.10568 |
| Kanovei V., Lyubetsky V., On Harrington"s model in which Separation holds but Reduction fails at the 3rd projective level, and on some related models of Sami.
arXiv:1810.12542 [math.LO], November 2018. http://iitp.ru/https://arxiv.org/abs/1810.12542 |
| Aleoshin V., Slyusarev G., Mikhailov K., Popova O., Rusin L., Zverkóv O., Lyubetsky V., Orthonectida and Dicyemida: Two stories of body plan simplification.
In: Molecular Phylogenetics (Eds.: A. Troitsky, L. Rusin),
Moscow: Torus Press, 2018, P. 3–4.
DOI: 10.30826/MolPhy2018-01 |
| Kanovei V., Lyubetsky V., A countable definable set of reals containing no definable elements,
arXiv:1408.3901v2 [math.LO], Sept. 2018, 11 p. http://arxiv.org/abs/1408.3901 |
| Seliverstov A., Shilovsky G.A., Rubanov L., Zverkóv O., Lyubetsky V., Longevity in mammals: lost genes as a determinant. Bioinformatics of Genome Regulation and Structure\Systems Biology (BGRS\SB-2018): The Eleventh International Conference (20–25 Aug. 2018, Novosibirsk, Russia); Abstracts / Institute of Cytology and Genetics, Siberian Branch of Russian Academy of Sciences; Novosibirsk State University. – Novosibirsk: ICG SB RAS, 2018. P. 249. http://conf.bionet.nsc.ru/bgrssb2018/en/ |
| Seliverstov A., Rubanov L., Shilovsky G., Zverkóv O., Lyubetsky V., Longevity in euarchontoglires: lost genes as a determinant.
FEBS Open Bio,
2018, Vol. 8 (Suppl. 1), P. 456–457;
DOI: 10.1002/2211-5463.12453. |
| Горбунов К.Ю., Любецкий В.А., Линейный алгоритм перестройки графа.
Автоматика и телемеханика,
2018, вып. 11, в печати |
| Lyubetsky V., Lyubetskaya E., Gorbunov K., A linear algorithm of cyclic graph reconfiguration.
Lobachevskii Journal of Mathematics,
2018, Iss. 6, in press |
| Kanovei V., Lyubetsky V., Definable E0 classes at arbitrary projective levels.
Annals of Pure and Applied Logic, 2018, Vol. 169, Iss. 9, P. 851–871. DOI: 10.1016/j.apal.2018.04.006 WoS Q1 http://iitp.ru/https://doi.org/10.1016/j.apal.2018.04.006 |
| Kanovei V., Lyubetsky V., Canonization of smooth equivalence relations on infinite-dimensional perfect cubes.
arXiv:1804.05174 [math.LO], April 2018. http://arxiv.org/abs/1804.05174 |
| Zverkóv O., Rubanov L., Rusin L., Seliverstov A., Lyubetsky V., Finding long highly conserved elements in complete animal genomes.
CEUR Workshop Proceedings,
Feb 23 2018, Vol. 2064, Convergent Cognitive Information Technologies 2017, P. 402–408, in Russian. http://ceur-ws.org/Vol-2064/paper47.pdf |
| Gorbunov K., Lyubetsky V., Transformation of large chromosome structures: an algorithm of equalization of gene contents.
CEUR Workshop Proceedings,
Feb 23 2018, Vol. 2064, Convergent Cognitive Information Technologies 2017, P. 395–401, in Russian. http://ceur-ws.org/Vol-2064/paper46.pdf |
| Kanovei V., Lyubetsky V., Countable OD sets of reals belong to the ground model.
Archive for Mathematical Logic, 2018, Vol. 57, Iss. 3–4, P. 285–298. DOI: 10.1007/s00153-017-0569-0 WoS Q3 http://link.springer.com/article/10.1007/s00153-017-0569-0 |
| Herzberg F., Kanovei V., Katz M., Lyubetsky V., Minimal axiomatic frameworks for definable hyperreals with transfer.
Journal of Symbolic Logic, 2018, 83, 1, pp. 385-391. DOI: 10.1017/jsl.2017.48 WoS Q1 http://iitp.ru/https://doi.org/10.1017/jsl.2017.48 |
| Кановей В.Г., Любецкий В.А., Неуниформизуемые множества второго проективного уровня со счетными сечениями в виде классов Витали.
Известия Российской академии наук. Серия математическая, 2018, том 82, № 1, стр. 65–96. DOI: 10.4213/im8521 WoS Q2 http://mi.mathnet.ru/izv8521 |
2017 |
| Lyubetsky V., Gershgorin R., Gorbunov K., Chromosome structures: reduction of certain problems with unequal gene content and gene paralogs to integer linear programming.
BMC Bioinformatics,
2017, Vol. 18, No. 537.
doi:10.1186/s12859-017-1944-x, PMID: 29212445 http://dx.doi.org/10.1186/s12859-017-1944-x |
| Kanovei V., Lyubetsky V., Non-uniformizable sets with countable cross-sections on a given level of the projective hierarchy.
arXiv:1712.00769 [math.LO], December 2017. http://iitp.ru/https://arxiv.org/abs/1712.00769 |
| Горбунов К.Ю., Любецкий В.А., Кратчайшее преобразование графа.
Доклады академии наук,
2017, том 476, № 6, стр. 614–616.
doi:10.7868/S0869565217300028 |
| Lyubetsky V., Korotkova D., Ivanova A., Rubanov L., Seliverstov A., Zverkóv O., Nesterenko A., Tereshina M., Zaraisky A.G., Novel transmembrane protein c-Answer revealed by bioinformatic screening of genes present only in well regenerating animals.
FEBS Journal, 2017, Vol. 284, Iss. S1, P. 155.
doi:10.1111/febs.14174 |
| Gorbunov K., Lyubetsky V., A linear algorithm for the shortest transformation of graphs with different operation costs.
Journal of Communications Technology and Electronics,
2017, Vol. 62, No. 6, P. 653–662.
doi:10.1134/S1064226917060092 |
| Korotkova D.D., Ivanova A.S., Lyubetsky V., Seliverstov A., Martynova N.Y., Nesterenko A.M., Zaraisky A.G., Novel FGF-signaling modulator c-Answer revealed by bioinformatics screening for genes present only in well-regenerative animals.
Mechanisms of Development,
2017, Vol. 145, P. S49.
doi:10.1016/j.mod.2017.04.089 |
| Kanovei V., Lyubetsky V., Definable minimal collapse functions at arbitrary projective levels.
arXiv:1707.07320 [math.LO], July 2017. http://iitp.ru/https://arxiv.org/abs/1707.07320 |
| Kanovei V., Lyubetsky V., Definable E0 classes at arbitrary projective levels.
arXiv:1705.02975 [math.LO], May 2017. http://iitp.ru/https://arxiv.org/abs/1705.02975 |
| Горбунов К.Ю., Любецкий В.А., Алгоритм преобразования одного графа в другой с минимальной ценой.
Информатика и её применения,
2017, том 11, вып. 1, стр. 79–89. doi:10.14357/19922264170107 |
| Горбунов К.Ю., Любецкий В.А., Линейный алгоритм минимальной перестройки структур.
Проблемы передачи информации,
2017, том 53, вып. 1, стр. 60–78. |
| Gershgorin R., Gorbunov K., Zverkóv O., Rubanov L., Seliverstov A., Lyubetsky V., Highly Conserved Elements and Chromosome Structure Evolution in Mitochondrial Genomes in Ciliates.
Life, 2017, Vol. 7, No. 9.
doi:10.3390/life7010009, PMID: 28264444 http://www.mdpi.com/2075-1729/7/1/9/htm |
| Kanovei V., Lyubetsky V., The full basis theorem does not imply analytic wellordering.
arXiv:1702.03566 [math.LO], February 2017. http://iitp.ru/https://arxiv.org/abs/1702.03566 |
| Кановей В.Г., Любецкий В.А., Генерическое свойство множества Σ по Соловею.
Сибирский математический журнал, 2017, том 58, вып. 6, стр. 1302–1305. doi:10.17377/smzh.2017.58.610 WoS Q3 http://iitp.ru/https://link.springer.com/article/10.1134%2FS0037446617060106 |
| Кановей В.Г., Любецкий В.А., Определимое счетное множество, не содержащее определимых элементов.
Математические заметки, 2017, 102, вып. 3, стр. 369-382. doi:10.4213/mzm10842 WoS Q3 http://www.mathnet.ru/php/archive.phtml?wshow=paper&jrnid=mzm&paperid=10842&option_lang=rus |
| Golshani M., Kanovei V., Lyubetsky V., A Groszek-Laver pair of undistinguishable E0-classes.
Mathematical Logic Quarterly, 2017, Vol. 63, No. 1–2, P. 19–31. doi:10.1002/malq.201500020 WoS Q3 http://onlinelibrary.wiley.com/wol1/doi/10.1002/malq.201500020/abstract |
2016 |
| Korolev S., Gorbunov K., Zverkóv O., Seliverstov A., Lyubetsky V., Degenerate inverted repeats in the genomes of mycobacterium.
CEUR Workshop Proceedings (CEUR-WS.org), Selected Papers of the First International Scientific Conference Convergent Cognitive Information Technologies (Convergent 2016), Moscow, Russia, November 25–26 2016, vol. 1763, p. 182–187, in Russian. |
| Lyubetsky V., Piel W., Stadler P., Molecular Phylogenetics 2016.
BioMed Research International, 2016, vol. 2016, Article ID 9029306, 2 pages, DOI: 10.1155/2016/9029306. http://iitp.ru/https://www.hindawi.com/journals/bmri/2016/9029306/ |
| Gorbunov K., Lyubetsky V., A modified algorithm for transformation of chromosomal structures: a condition of absolute exactness.
CEUR Workshop Proceedings (CEUR-WS.org), Selected Papers of the First International Scientific Conference Convergent Cognitive Information Technologies (Convergent 2016), Moscow, Russia, November 25–26 2016, vol. 1763, p. 162–172, in Russian. |
| Горбунов К.Ю., Любецкий В.А., Линейный алгоритм кратчайшей перестройки графов при разных ценах операций.
Информационные процессы, 2016, том 16, № 2, стр. 223–236. |
| Lyubetsky V., Seliverstov A., A Novel Algorithm for Solution of a Combinatory Set Partitioning Problem.
Journal of Communications Technology and Electronics, 2016, vol. 61, no. 6, p. 705–708. |
| Рубанов Л.И., Селиверстов А.В., Зверко́в О.А., Любецкий В.А., A method for identification of highly conserved elements and evolutionary analysis of superphylum Alveolata. BMC Bioinformatics. 2016, vol. 17, no. 385, 16 p. http://dx.doi.org/10.1186/s12859-016-1257-5 |
| Рубанов Л.И., Зверко́в О.А., Селиверстов А.В., Любецкий В.А., Высоко консервативные элементы в митохондриях однодольных растений. Современные информационные технологии и ИТ-образование. 2016. Том 12, №2. С. 211-215. |
| Королев С.А., Горбунов К.Ю., Зверко́в О.А., Селиверстов А.В., Любецкий В.А., Вырожденные инвертированные повторы в геномах микобактерий. Современные информационные технологии и ИТ-образование. 2016. Том 12, №1. С. 162-172. |
| Kanovei V., Lyubetsky V., A generic property of Solovay"s set Σ.
arXiv:1611.00176 [math.LO], pp. 1-4, November 2016. http://iitp.ru/https://arxiv.org/abs/1611.00176 |
| Kanovei V., Lyubetsky V., In Cohen generic extension, every countable OD set of reals belongs to the ground model.
July 2016, arXiv:1607.02880 [math.LO] pp. 1-3. http://iitp.ru/https://arxiv.org/abs/1607.02880 |
| Любецкий В.А., Гершгорин Р.А., Селиверстов А.В., Горбунов К.Ю., Algorithms for reconstruction of chromosomal structures. BMC Bioinformatics, 2016, 17:40, 23 p. DOI: 10.1186/s12859-016-0878-z http://bmcbioinformatics.biomedcentral.com/articles/10.1186/s12859-016-0878-z |
| Kanovei V., Lyubetsky V., Countable OD sets of reals belong to the ground model.
September 2016, arXiv:1609.01032 [math.LO], pp. 1-12. http://arxiv.org/abs/1609.01032 |
| Korolev S., Zverkóv O., Seliverstov A., Lyubetsky V., Ribosome reinitiation at leader peptides increases translation of bacterial proteins.
Biology Direct, 2016, vol. 11, no. 20, 6 pages, DOI: 10.1186/s13062-016-0123-8, PMID: 27084079. http://biologydirect.biomedcentral.com/articles/10.1186/s13062-016-0123-8#CR11 |
| Zverkóv O., Seliverstov A., Lyubetsky V., Regulation of Expression and Evolution of Genes in Plastids of Rhodophytic Branch.
Life, 2016, vol. 6, no. 7, 13 pages, DOI: 10.3390/life6010007, PMID: 26840333. http://www.mdpi.com/2075-1729/6/1/7/htm |
| Kanovei V., Lyubetsky V., Counterexamples to countable-section $Pi^1_2$ uniformization and $Pi^1_3$ separation.
Annals of Pure and Applied Logic, 2016, 167, 3, pp. 262–283. DOI: 10.1016/j.apal.2015.12.002 WoS Q1 http://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S0168007215001268 |
| Kanovei V., Lyubetsky V., On countable cofinality and decomposition of definable thin orderings.
Fundamenta mathematicae, 2016, 235, no 1, pp. 13-36. DOI: 10.4064/fm977-10-2015 , WoS Q3 SCOPUS, Q2 http://iitp.ru/https://www.impan.pl/en/publishing-house/journals-and-series/fundamenta-mathematicae/online/91557/on |
2015 |
| Lyubetsky V., Molecular Phylogenetics 2014.
BioMed Research International,
2015, vol. 2015, Article ID 919251, 2 pages,
DOI: 10.1155/2015/919251. http://www.hindawi.com/journals/bmri/2015/919251/ |
| Любецкий В.А., Горбунов К.Ю., Реконструкция предковых хромосомных структур.
Современные информационные технологии и ИТ-образование,
2015, том 2, № 11, стр. 600–605. |
| Любецкий В.А., Селиверстов А.В., Новый алгоритм решения комбинаторной задачи о разбиении множества.
Информационные процессы, 2015, том 15, № 3, стр. 337–342. |
| Любецкий В.А., Селиверстов А.В., Об алгоритме решения NP-полной задачи, если решений нет или их нечётное число.
International Journal of Open Information Technologies,
2015, том 3, № 11, стр. 1–3. |
| Королев С.А., Селиверстов А.В., Любецкий В.А., "О трансляции рибосомного белка L16 в пластидах цветковых растений" Современные информационные технологии и ИТ-образование. 2015, том 2, № 11, стр. 606-607. |
| Рубанов Л.И., Селиверстов А.В., Любецкий В.А., "Широкомасштабный поиск ультраконсервативных элементов в полных геномах" Современные информационные технологии и ИТ-образование. 2015, том 2, № 11, стр. 586-593.
|
| Рубанов Л.И., Селиверстов А.В., Зверко́в О.А., Любецкий В.А., «Ультраконсервативные элементы у простейших из надтипа Alveolata»
Современные информационные технологии и ИТ-образование
2015, том 2, № 11, стр. 581–585. |
| Зверко́в О.А., Селиверстов А.В., Любецкий В.А., «О транскрипционных факторах, кодируемых в пластидах родофитной ветви»
Современные информационные технологии и ИТ-образование
2015, том 2, № 11, стр. 571–575. |
| Любецкий В.А., Селиверстов А.В., "О решении одной NP-полной задачи" Современные информационные технологии и ИТ-образование. 2015, том 2, № 11, стр. 569-570.
|
| Королев С.А., Селиверстов А.В., Зверко́в О.А., Любецкий В.А., «Классическая аттенюаторная регуляция, зависимая от концентрации триптофана, у актинобактерий»
Современные информационные технологии и ИТ-образование
2015, том 2, № 11, стр. 565–568. |
| Zverkóv O., Seliverstov A., Lyubetsky V., “A Database of Plastid Protein Families from Red Algae and Apicomplexa and Expression Regulation of the moeB Gene“
BioMed Research International,
2015, Vol. 2015, Article ID 510598, 5 pages,
DOI: 10.1155/2015/510598, PMID: 26114108. http://www.hindawi.com/journals/bmri/2015/510598/ |
| Горбунов К.Ю., Гершгорин Р.А., Любецкий В.А., Перестройка и реконструкция хромосомных структур.
Молекулярная биология, 2015, том 49, № 3, стр. 372–383,
DOI: 10.7868/S0026898415030076, PMID: 26107890. |
| Kanovei V., Lyubetsky V., “Grossone approach to Hutton and Euler transforms”
Applied Mathematics and Computation,
2015, 255, pp. 36–43.
DOI: 10.1016/j.amc.2014.06.037 , WoS Q1 http://dx.doi.org/10.1016/j.amc.2014.06.037 |
| Kanovei V., Lyubetsky V., A definable $E_0$ class containing no definable elements,
Archive for Mathematical Logic, 2015, 54, 5, pp. 711--723.
DOI: 10.1007/s00153-015-0436-9 SCIMAGO, Q1 SCOPUS, Q1 http://link.springer.com/article/10.1007/s00153-015-0436-9 |
| Кановей В.Г., Любецкий В.А., Обобщение одной конструкции Соловея.
Сибирский математический журнал,
2015, том 56, № 6, стр. 1341–1350.
DOI: 10.17377/smzh.2015.56.611 , SCIMAGO, Q2 http://iitp.ru/https://link.springer.com/article/10.1134/S0037446615060117 |
| Кановей В.Г., Любецкий В.А., Об эффективной σ-ограниченности и σ-компактности в модели Соловея.
Математические заметки, 2015, том 98, вып. 2, стр. 247–257,
DOI: 10.4213/mzm10415 SCIMAGO, Q2 http://www.mathnet.ru/php/archive.phtml?wshow=paper&jrnid=mzm&paperid=10415&option_lang=rus |
2014 |
| Kanovei V., Lyubetsky V., On countable cofinality and decomposition of definable thin orderings, arXiv:1412.0195 [math.LO], Dec. 2014, 21 p.
http://arxiv.org/abs/1412.0195 |
| Kanovei V., Lyubetsky V., Counterexamples to countable-section Π12 uniformization and Π13 separation, arXiv:1410.2537 [math.LO], Oct. 2014, 18 p. http://arxiv.org/abs/1410.2537 |
| Kanovei V., Lyubetsky V., A definable $E_0$-class containing no definable elements, arXiv:1408.6642 [math.LO], Aug 2014, 12 p. http://arxiv.org/abs/1408.6642 |
| Kanovei V., Lyubetsky V., A countable definable set of reals containing no definable elements,
arXiv:1408.3901 [math.LO], Aug. 2014, 11 p. http://arxiv.org/abs/1408.3901 |
| Kanovei V., Lyubetsky V., Linearization of partial quasi-orderings in the Solovay model revisited, arXiv:1408.1202 [math.LO], Aug. 2014, 13 p. http://arxiv.org/abs/1408.1202 |
| Zverkóv O., Seliverstov A., Lyubetsky V., “A database of Rhodophyte plastid protein families and regulation of moeB genes”
Abstracts of the Ninth International Conference on Bioinformatics of Genome Regulation and StructureSystems Biology (BGRSSB"2012),
Novosibirsk, Russia, June 23–28 2014, p. 176. |
| Rusin L., Lyubetskaya E., Gorbunov K., Lyubetsky V., “Reconciliation of Gene and Species Trees”
BioMed Research International,
2014, Vol. 2014, Article ID 642089, 22 pages. http://dx.doi.org/10.1155/2014/642089 |
| Lyubetsky V., Korolev S., Seliverstov A., Zverkóv O., Rubanov L., “Gene expression regulation of the PF00480 or PF14340 domain proteins suggests their involvement in sulfur metabolism”
Computational Biology and Chemistry,
2014, vol. 49, p. 7–13. http://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S1476927114000036 |
2013 |
| Любецкий В.А., Горбунов К.Ю., «Задачи и алгоритмы, связанные с хромосомными перестройками»
Сборник избранных трудов VIII Международной научно-практической конференции «Современные информационные технологии и ИТ-образование»,
Москва, МГУ им. М. В. Ломоносова, 8–10 ноября 2013, М.: ИНТУИТ.РУ, 2013, стр. 764–768. |
| Любецкий В.А., Селиверстов А.В., Зверко́в О.А., «Семейства пластомных белков зелёных водорослей и растений»
Материалы VII Московского Международного Конгресса «Биотехнология: состояние и перспективы развития»,
Москва, ул. Новый Арбат, 36/9, 19–22 марта 2013. |
| Lyubetsky V., Korolev S., Seliverstov A., Zverkóv O., “Rho-dependent attenuation of sulfur metabolism in mycobacteria”
Proceedings of the International Moscow Conference on Computational Molecular Biology: MCCMB’13, Moscow, Russia, July 25–28 2013. |
| Kobets N., Goncharov D., Seliverstov A., Zverkóv O., Lyubetsky V., “Comparative analysis of apicoplast-targeted proteins in Toxoplasma gondii and other Apicomplexa species”
Proceedings of the International Moscow Conference on Computational Molecular Biology: MCCMB’13,
Moscow, Russia, July 25–28 2013.
|
| Любецкий В.А., Селиверстов А.В., Зверко́в О.А., Построение разделяющих паралоги семейств гомологичных белков, кодируемых в пластидах цветковых растений.
Математическая биология и биоинформатика.
2013, том 8, № 1, стр. 225–233. |
| Зверко́в О.А., Селиверстов А.В., Любецкий В.А., Усредненная энтропия как характеристика консервативности участков генома.
Вестник Тамбовского университета. Серия: Естественные и технические науки.
2013, том 18, вып. 5, стр. 2529–2531. |
| Lyubetsky V., Seliverstov A., Zverkóv O., Transcription Regulation of Plastid Genes Involved in Sulfate Transport in Viridiplantae.
BioMed Research International. 2013, Vol. 2013, Article ID 413450.
DOI: 10.1155/2013/413450, PMID: 24073405 http://www.hindawi.com/journals/bmri/2013/413450/ |
| Кановей В.Г., Любецкий В.А., Современная теория множеств: абсолютно неразрешимые классические проблемы.
М., МЦНМО, 2013, 384 c.,
Монография ISBN: 978-5-4439-0097-1. http://biblio.mccme.ru/node/2878 |
| Kanovei V., Lyubetsky V., On effective $sigma$-boundedness and $sigma$-compactness,
Mathematical Logic Quarterly,
2013, 59, no 3,
pp. 147-166.
doi: 10.1002/malq.201200001 http://onlinelibrary.wiley.com/doi/10.1002/malq.201200001/full |
| Зверко́в О.А., Русин Л.Ю., Селиверстов А.В., Любецкий В.А., Изучение вставок прямых повторов в микроэволюции митохондрий и пластид растений на основе кластеризации белков.
Вестник Московского университета. Серия 16. Биология. 2013, № 1, стр. 8–13.
DOI: 10.3103/S0096392513020119 |
2012 |
| Lyubetsky V., Rubanov L., Rusin L., Gorbunov K., "Cubic time algorithms of amalgamating gene trees and building evolutionary scenarios" Biology Direct, 2012, 7:48. PMID: 24513779 http://www.biologydirect.com/content/7/1/48 |
| Королев С.А., Любецкий В.А., С.А. Королев, В.А. Любецкий «Распределение и роль длинных шпилек» Труды 55-й научной конференции МФТИ: Всероссийской научной конференции «Проблемы фундаментальных и прикладных естественных и технических наук в современном информационном обществе», Научной конференции «Современные проблемы фундаментальных и прикладных наук в области физики и астрономии», Всероссийской молодежной научной конференции «Современные проблемы фундаментальных и прикладных наук». Управление и прикладная математика. Том 1. - М.: МФТИ, 2012. - стр. 94-95. |
| Зверко́в О.А., Селиверстов А.В., Любецкий В.А., Белковые семейства, специфичные для пластомов небольших таксономических групп водорослей и простейших.
Молекулярная биология. 2012, том 46, № 5, стр. 799–809.
PMID: 23156680 |
| Калинина А.С., Селиверстов А.В., Любецкий В.А., «Супердеревья пластид хлорофитной ветви водорослей и животных Ecdysozoa»
Труды 35-й конференции «Информационные технологии и системы» (ИТиС’12),
г. Петрозаводск, 19–25 августа 2012, стр. 307–311. http://www.itas2012.iitp.ru/pdf/1569599597.pdf |
| Зверко́в О.А., Селиверстов А.В., Любецкий В.А., Семейства белков, кодируемых в пластомах Chlorophyta, Euglenozoa и Rhizaria.
Труды 35-й конференции «Информационные технологии и системы» (ИТиС’12),
г. Петрозаводск, 19–25 августа 2012, стр. 298–302. http://www.itas2012.iitp.ru/pdf/1569591277.pdf |
| Gorbunov K., Lyubetsky V., “The problems of reconciling gene and species trees, mapping a gene tree into a species tree, and gene tree inference”
Abstracts of the First RECOMB Satellite Conference on Open Problems in Algorithmic Biology (RECOMB-AB),
St. Petersburg, Russia, August 27–29 2012. |
| Зверко́в О.А., Русин Л.Ю., Селиверстов А.В., Любецкий В.А., Вставки прямых повторов в микроэволюции пластид и митохондрий семенных растений
Информационные процессы.
2012, том 12, вып. 3, стр. 191–197. http://www.jip.ru/2012/191-197-2012.pdf |
| Лопатовская К.В., Зверко́в О.А., Селиверстов А.В., Любецкий В.А., Регуляция транскрипции гена chlL у Viridiplantae.
Информационные процессы.
2012, том 12, вып. 3, стр. 172–175. http://www.jip.ru/2012/172-175-2012.pdf |
| Горбунов К.Ю., Селиверстов А.В., Любецкий В.А., “Взаимное расположение параллельных гиперплоскостей, квадрик и вершин многомерного куба”, Проблемы передачи информации, 2012, 48:2, 113-120. http://dx.doi.org/10.1134%2FS0032946012020081 |
| Lyubetsky V., Zverkóv O., Pirogov S., Rubanov L., Seliverstov A., Modeling RNA polymerase interaction in mitochondria of chordates.
Biology Direct. 2012, 7:26.
DOI: 10.1186/1745-6150-7-26, PMID: 22873568 http://www.biology-direct.com/content/7/1/26 |
| Zverkóv O., Korolev S., Seliverstov A., Lyubetsky V., Transcription regulation of plastid genes cysT and cysA in Viridiplantae.
in: Molecular Phylogenetics (Eds.: A. Troitsky, L. Rusin, V. Aleoshin),
Moscow, Torus Press, 2012, P. 85. |
| Seliverstov A., Lyubetsky V., “About Forms Equal to Zero at Each Vertex of a Cube”
Journal of Communications Technology and Electronics,
2012, Vol. 57, No. 8, P. 892–895. |
| Seliverstov A., Lyubetsky V., “Modeling RNA Polymerase Interaction in Plastids of Plants, Algea and Mitochondria of Chordates: Human Bearing the MELAS Mutation and Rat with Hyposecretion of Thyroid Hormone”
Proceedings of the Eighth International Conference on Bioinformatics of Genome Regulation and StructureSystems Biology (BGRSSB"2012),
Novosibirsk, Russia, June 25–29 2012, P. 189. |
| Кановей В.Г., Любецкий В.А., Об эффективной компактности и сигма-компактности,
Математические заметки,
2012, том 91, вып. 6, стр. 840–852. http://mi.mathnet.ru/rus/mz/v91/i6/p840 |
| Kanovei V., Lyubetsky V., An infinity which depends on the axiom of choice,
Applied Mathematics and Computation,
Vol. 218, Iss. 16, April 15 2012, P. 8196–8202,
http://dx.doi.org/10.1016/j.amc.2011.05.003 |
| Горбунов К.Ю., Любецкий В.А., «Быстрый алгоритм построения супердерева видов по набору белковых деревьев»
Молекулярная биология,
2012, том 46, № 1, стр. 176–183. |
2011 |
| Селиверстов А.В., Любецкий В.А., «О формах, равных нулю в каждой вершине куба»
Информационные процессы,
2011, том 11, № 3, стр. 330–335. http://www.jip.ru/2011/330-335-2011.pdf |
| Любецкая Е.В., Горбунов К.Ю., Селиверстов А.В., Любецкий В.А., «Дифференциальные уравнения, описывающие клеточный процесс»
Труды 54-й научной конференции МФТИ «Проблемы фундаментальных и прикладных естественных и технических наук в современном информационном обществе». Управление и прикладная математика,
том 2, М.: МФТИ, 2011, стр. 91–92. |
| Зверко́в О.А., Горбунов К.Ю., Селиверстов А.В., Любецкий В.А., Кластеризация белков с учётом их доменной структуры.
Труды 54-й научной конференции МФТИ «Проблемы фундаментальных и прикладных естественных и технических наук в современном информационном обществе», 25–26 ноября 2011, Москва, 25–26 ноября 2011, М.: МФТИ, 2011, Управление и прикладная математика, том 2, стр. 88–89. |
| Кановей В.Г., Любецкий В.А., «Эффективная минимальная кодировка несчетных множеств»
Сибирский математический журнал,
2011, том 52, № 5, сс. 1074–1086. http://www.springerlink.com/content/hgwv8882kl061v70/ |
| Любецкий В.А., Рубанов Л.И., Селиверстов А.В., «Тканеспецифичная транскрипция в митохондриях хордовых в процессе онтогенеза»
Юбилейная конференция «50лет ИППИ РАН. Нейрофизиология, биофизика и психофизика в ИППИ РАН: истоки и современность»,
Москва, сентябрь 2011, стр. 54–58. |
| Селиверстов А.В., Любецкий В.А., «Эволюция РНК-полимераз и их промоторов в пластидах»
Юбилейная конференция «50лет ИППИ РАН. Нейрофизиология, биофизика и психофизика в ИППИ РАН: истоки и современность»,
Москва, сентябрь 2011, стр. 58–62. |
| Lyubetsky V., Seliverstov A., ”Mathematical problems in biological evolution and molecular regulation“
Proceedings of the International Mathematical Conference “50 Years of IITP”,
Moscow, Russia, July 25–29, 2011, 7 pages. http://iitp.ru/upload/content/839/Lyubetsky%20Seliverstov.pdf |
| Kanovei V., Lyubetsky V., On the infinitary pantachie of Du Bois Reymond,
Proceedings of the International Mathematical Conference “50 Years Of IITP”,
Moscow, Russia, July 25–29, 2011, 7 pages. http://iitp.ru/upload/content/839/Kanovei.pdf |
| Gorbunov K., Rubanov L., Rusin L., Lyubetsky V., “An accurate algorithm of cubic complexity to build supertrees”
Zitteliana. An International Journal of Palaeontology and Geobiology. Series B,
Vol. 30, Abstracts of the international conference “Deep Metazoan Phylogeny 2011 – new data, new challenges", Munchen, Germany, October 11–14 2011, P. 20. |
| Горбунов К.Ю., Любецкий В.А., «Дерево, ближайшее в среднем к данному набору деревьев»
Проблемы передачи информации,
том 47, вып. 3, 2011, сс. 64–79. |
| 154, Селиверстов А.В., Любецкий В.А., «Транскрипция в пластидах кокцидий»
Труды 34-й конференции «Информационные технологии и системы» (ИТиС’11)
г. Геленджик, 2–7 октября 2011, стр. 20–24. http://itas2011.iitp.ru/pdf/1569455191.pdf |
| 154, Seliverstov A., Lyubetsky V., “Bacterial type RNA polymerase sigma subunits and their specific promoters in plastids”
Proceedings of the International Moscow Conference on Computational Molecular Biology: MCCMB’11, July 21–24, 2011, pp. 209–210. http://mccmb.belozersky.msu.ru/2011/mccmb11.pdf |
| 154, Селиверстов А.В., Любецкий В.А., «Регулоны NtcA и NtcB у цианобактерий и хлоропластов»
Труды VI московского международного конгресса «Биотехнология: состояние и перспективы развития» (21-25 марта 2011), сс. 395–396. |
| 154, Селиверстов А.В., Любецкий В.А., «Регулоны NtcA и NtcB у цианобактерий и хлоропластов водорослей отдела Rhodophyta»
Молекулярная биология, том 45, № 3, 2011, сс. 570–574. http://www.springerlink.com/content/83173k2162213k56/ |
| Lyubetsky V., Zverkóv O., Rubanov L., Seliverstov A., Modeling RNA polymerase competition: the effect of σ-subunit knockout and heat shock on gene transcription level.
Biology Direct. 2011, 6:3.
DOI: 10.1186/1745-6150-6-3, PMID: 21255416 http://www.biology-direct.com/content/6/1/3 |
2010 |
| Kanovei V., Lyubetsky V., Julius Koenig sets as higher infinity,
Infinite and Infinitesimal in Mathematics and Natural Sciences. International Workshop, 17-21 May 2010, Book of Abstracts, p. 27, University of Calabria, Italy, 2010. http://www.theinfinitycomputer.com/Infinity2010/Abstracts_Infinity2010.pdf |
| Селиверстов А.В., Любецкий В.А., «О функции Гильберта множества вершин куба»
Труды 53-й научной конференции МФТИ, Москва, МФТИ, 2010, часть 1, том 1, сс. 123–124. http://mipt.ru/nauka/53conf/Materialy+53+konferenzii/01-FRTK1-view-arpggzeu7il.pdf |
| Щелкунов М.И., Любецкий В.А., «Электростатическое поле и длина межгенных областей связаны с диффузией белковых факторов»
Труды 33-й конференции «Информационные технологии и системы» (ИТиС’10),
г. Геленджик, 20-24 сентября 2010, сс. 382–384. http://www.itas-proceedings.iitp.ru/pdf/1569325479.pdf |
| 154, Селиверстов А.В., Любецкий В.А., «Регулоны факторов NtcA и NtcB у цианобактерий и багрянок»
Труды 33-й конференции «Информационные технологии и системы» (ИТиС’10),
г. Геленджик, 20-24 сентября 2010, сс. 339–342. http://www.itas-proceedings.iitp.ru/pdf/1569320755.pdf |
| Lyubetsky V., Seliverstov A., “Fast and Slow Evolution of Bacterial Type Promoters in Plastids of Streptophyta”
Molecular Phylogenetics: Contributions to the 2nd Moscow International Conference “Molecular Phylogenetics” (Moscow, Russia, May 18-21, 2010), Moscow, Torus Press, 2010, p. 54. |
| 154, Seliverstov A., Lyubetsky V., “The Evolution of NtcA- and NtcB-regulons in Cyanobacteria and Rhodophyte Chloroplasts”
Molecular Phylogenetics: Contributions to the 2nd Moscow International Conference “Molecular Phylogenetics” (Moscow, Russia, May 18-21, 2010), Moscow, Torus Press, 2010, pp. 134–135. |
| 154, Gorbunov K., Seliverstov A., Lyubetsky V., “The evolution of proline synthesis transcription regulation in gamma proteobacteria”
Molecular Phylogenetics: Contributions to the 2nd Moscow International Conference “Molecular Phylogenetics” (Moscow, Russia, May 18-21, 2010), Moscow, Torus Press, 2010, pp. 132–133. |
| Seliverstov A., Rubanov L., Lyubetsky V., “Lack of Conservation of Bacterial Type Promoters in Plastids of Streptophyta”
Proceedings of the Seventh International Conference on Bioinformatics of Genome Regulation and StructureSystems Biology (BGRSSB’2010), Novosibirsk, Russia, 20-27 June 2010, p. 170. |
| Lyubetsky V., Zverkóv O., Rubanov L., Seliverstov A., Interaction between nucleome and plastome: heat shock response regulation in plastids of plants.
Proceedings of the Seventh International Conference on Bioinformatics of Genome Regulation and Structure\Systems Biology (BGRS\SB"2010), Novosibirsk, Russia, June 20–27 2010, P. 161. |
| Gorbunov K., Lyubetsky V., “A Fast Algorithm of Building Species Supertrees with a Set of Gene Trees”
Proceedings of the Seventh International Conference on Bioinformatics of Genome Regulation and StructureSystems Biology (BGRSSB’2010), Novosibirsk, Russia, 20-27 June 2010, p. 92. |
| Селиверстов А.В., Любецкий В.А., «О вещественных точках на многообразии четвёртой степени, ближайших к данной точке»
Информационные процессы,
том 10, № 3, 2010, сс. 245–246. http://www.jip.ru/2010/245-246-2010.pdf |
| Горбунов К.Ю., Любецкий В.А., «Об одном алгоритме согласования деревьев генов и видов с учетом дупликаций, потерь и горизонтальных переносов генов»
Информационные процессы
том 10, № 2, 2010, сс. 140–144. http://www.jip.ru/2010/140-144-2010.pdf |
| Lyubetsky V., Rubanov L., Seliverstov A., “Lack of conservation of bacterial type promoters in plastids of Streptophyta”
Biology Direct 2010, 5:34.
PMID: 20459727 http://www.biology-direct.com/content/5/1/34 |
| 154, Горбунов К.Ю., Русин Л.Ю., Селиверстов А.В., Любецкий В.А., «Эволюция транскрипционной регуляции синтеза пролина у гамма-протеобактерий»
Вестник МГУ. Биология, 2010, том 65, № 4, сс. 92–94. |
| Кановей В.Г., Любецкий В.А., Современная теория множеств: борелевские и проективные множества,
М.: МЦНМО, 2010, 320 стр. Монография
ISBN 978-5-94057-683-9 http://www.mccme.ru/free-books/#kanovej |
| Зверко́в О.А., Селиверстов А.В., Любецкий В.А., Об одном алгоритме кластеризации белков.
Труды 53-й научной конференции МФТИ «Современные проблемы фундаментальных и прикладных наук», Москва, 24–29 ноября 2010, М.: МФТИ, 2010, часть I, том 1, стр. 118–119. http://mipt.ru/nauka/53conf/Materialy+53+konferenzii/01-FRTK1-view-arpggzeu7il.pdf |
| Зверко́в О.А., Селиверстов А.В., Любецкий В.А., Позиционная связь генов пластомов растений и водорослей.
Труды 33-й конференции «Информационные технологии и системы» (ИТиС’10), г. Геленджик, 20–24 сентября 2010, стр. 326–330. http://www.itas-proceedings.iitp.ru/pdf/1569319815.pdf |
| Gorbunov K., Laikova O.N., Rodionov D., Gelfand M., Lyubetsky V., “Evolution of regulatory motifs of bacterial transcription factors”
In Silico Biology, 2010, 10, 0012. http://www.bioinfo.de/isb/2010/10/0012/ |
| 154, Селиверстов А.В., Любецкий В.А., «Аттенюаторная регуляция оперонов биосинтеза аминокислот и аминоацил-тРНК у бактерий: сравнительный геномный анализ»
Молекулярная биология,
2010, том 44, № 1, с. 140–151. |
2009 |
| Kanovei V., Lyubetsky V., Borel reducibility as an additive property of domains,
Journal of Mathematical Sciences,
2009, Vol. 158, No. 5, P. 708–712. http://www.springerlink.com/content/t61n117p753548n1/ |
| Rusin L., Aleoshin V., Lyubetsky V., “A phylogenomic pipeline to construct multi-gene datasets and infer multi-gene trees”,
Proceedings of the international conference “Celebrating Darwin: from the Origin of Species to Deep Metazoan Phylogeny, DMP’09”, Berlin, Germany, March 4–6 2009. |
| Любецкий В.А., Селиверстов А.В., «Прямые повторы в некодирующих областях хлоропластов у семенных растений»
Труды 52-й научной конференции МФТИ,
2009, Москва, сс. 116–117. |
| Селиверстов А.В., Любецкий В.А., «Об эллипсоидах, внутри которых нет целых точек»
Труды 52-й научной конференции МФТИ,
2009, Москва, сс. 128–130. |
| Зверко́в О.А., Селиверстов А.В., Рубанов Л.И., Любецкий В.А., Моделирование конкуренции РНК-полимераз: влияние нокаута сигма субъединицы и температуры на экспрессию генов.
Труды 32-й конференции «Информационные технологии и системы» (ИТиС’09), пос. д/о Бекасово, 15–18 декабря 2009, стр. 328–331. http://www.iitp.ru/upload/content/539/itas09_proceedings.pdf |
| Зверко́в О.А., Селиверстов А.В., Любецкий В.А., Транскрипция генов синтеза пролина у бактерий родов Marinobacter, Pseudomonas и Shewanella регулируется белком семейства tetR.
Труды 32-й конференции «Информационные технологии и системы» (ИТиС’09), пос. д/о Бекасово, 15–18 декабря 2009, стр. 278–281. http://www.iitp.ru/upload/content/539/itas09_proceedings.pdf |
| Kanovei V., Lyubetsky V., Reeken M., Nonstandard class and superset theories,
Logic and Mathematics, The University of York, 3-7 August, 2009.
Department of Mathematics, University of York, 2009, p. 21. http://maths.york.ac.uk/www/sites/default/files/kanovei-slides.pdf |
| Lyubetsky V., 154, “Comparative genomic analysis of the attenuation regulation of amino acid and amino acyl-tRNA biosynthesis operons in bacteria” International Moscow Conference on Computational Molecular Biology: MCCMB’09, pp. 219–220. |
| 154, Seliverstov A., Lyubetsky V., “Chlorophyll synthesis regulation in plant chloroplasts” International Moscow Conference on Computational Molecular Biology: MCCMB’09, pp. 217–218. |
| Gorbunov K., Lyubetsky V., “Inferring gene evolution along a species tree” International Moscow Conference on Computational Molecular Biology: MCCMB’09, pp. 120–121. |
| Любецкий В.А., Рубанов Л.И., Селиверстов А.В., «Конкуренция РНК-полимераз, транскрибирующих локус в противоположных направлениях» Труды съезда генетиков и селекционеров и Пятый съезд Вавиловского общества генетиков и селекционеров, Москва, 21–27 июня 2009, часть II, с. 68. |
| Lyubetsky V., Zhizhina E., Rubanov L., “Gibbs Field for Evolutionary Analysis of Regulatory Signal of Gene Expression under Constraints on Secondary Structure” The 18th IMACS World Congress on Computational and Applied Mathematics & Applications in Science and Engineering, August 3-5, 2009, The University of Georgia, Athens, GA 30602-7404, USA, р. 54. |
| Любецкий В.А., Селиверстов А.В., «Регуляция экспрессии пластидных белков у паразитов, водорослей и растений» Труды 5-го Биоинформатического конгресса, 2009, Москва, сс. 387–388. |
| Горбунов К.Ю., Любецкий В.А., «Реконструкция эволюции генов вдоль дерева видов»
Молекулярная биология,
2009, том 43, № 5, сс. 946–958. |
| Горбунов К.Ю., Любецкая Е.В., Асарин Е.В., Любецкий В.А., «Реконструкция эволюции бактериальных регуляторных сигналов, основанных на вторичной структуре»
Молекулярная биология,
2009, том 43, № 3, стр. 527–541. |
| Mikhailov K.V., Konstantinova A.V., Nikitin M.A., Troshin P.V., Rusin L., Lyubetsky V., Panchin Y., Mylnikov A.P., Moroz L.L., Kumar S., Aleoshin V.V., “The origin of Metazoa: a transition from temporal to spatial cell differentiation”
BioEssays,
2009, V. 31, Issue 07, pp. 758–768.
PMID: 19472368 |
| Селиверстов А.В., Лысенко Е.А., Любецкий В.А., «Быстрая эволюция промоторов пластомных генов ndhF у цветковых растений»
Физиология растений,
2009, том 56, № 6, сс. 926–934. |
| Селиверстов А.В., Любецкий В.А., «Совместная регуляция белков, гомологичных рубредоксину, у диатомовых водорослей и паразитов Piroplasmida»
Информационные процессы,
2009, т. 9, № 1, сс. 30–33. http://www.jip.ru/2009/30-33-2009.pdf |
| Селиверстов А.В., Любецкий В.А., «Механизм регуляции транспорта марганца у Brucella с участием длинной спирали РНК»
Биофизика,
2009, т. 54, вып. 2, сс. 222-225. |
| Kanovei V., Lyubetsky V., Reasonable non-Radon-Nikodym ideals,
Topology and its Applications,
2009, 156, 5, pp. 911–914. http://iitp.ru/ http://dx.doi.org/10.1016/j.topol.2008.11.008 |
| Селиверстов А.В., Любецкий В.А., «О симметричных матрицах с неопределенной главной диагональю»
Проблемы передачи информации,
2009, том 45, вып. 3, сс. 73–78. http://mi.mathnet.ru/rus/ppi/v45/i3/p73 |
2008 |
| Mikhailov K., Konstantinova A., Nikitin M., Troshin P., Rusin L., Lyubetsky V., Panchin Yu., Mylnikov A., Moroz L., Kumar S., Aleoshin V., “The Gastrea theory in postgenomic age: cell differentiation preceded multicellularity in early metazoan evolution”
Proceedings of the ICREA Conference on the Origin and Early Evolution of Metazoans, Barcelona Spain, October 24–25 2008. |
| Rusin L., Lyubetsky V., Kumar S., “Phylogenomic pipeline and construction of a multi-gene dataset for Metazoa”
Proceedings of the Annual Meeting of the Society for Molecular Biology and Evolution SMBE’2008, Barcelona Spain, June 5–8 2008. |
| Селиверстов А.В., Любецкий В.А., «О квадратичных формах ранга n-2, равных единице на большом множестве вершин n-мерного куба»
Труды 51-й научной конференции МФТИ,
Москва, 2008, сс. 150–153. http://frtk.ru/conf/probl_pered_obrab_inf/Seliverstov1-site-arpfsytjo57.pdf |
| Селиверстов А.В., Любецкий В.А., «Алгоритмы для поиска многобоксовых сигналов и их применения»
Труды 51-й научной конференции МФТИ,
2008, Москва, сс. 147–149. |
| 154, Селиверстов А.В., Любецкий В.А., «Об одном подходе к поиску регуляции в дискретных последовательностях»
Труды 51-й научной конференции МФТИ,
Москва, 2008, сс. 141–143. http://frtk.ru/conf/probl_pered_obrab_inf/Lopatovskaya-site-arpfsytjn7m.pdf |
| Lyubetsky V., Seliverstov A., “On evolution of promoters in plastomes”
Abstracts of The Sixth International Conference on Bioinformatics of Genome Regulation and Structure (BGRS’2008), Novosibirsk, June 22–28, p. 217. http://www.bionet.nsc.ru/meeting/bgrs2008/BGRS2008_Proceedings.pdf |
| Lysenko E., Seliverstov A., Lyubetsky V., “Analysis of Sig3, Sig4 and Sig6 evolution on new genomic data”
Abstracts of The Sixth International Conference on Bioinformatics of Genome Regulation and Structure (BGRS’2008), Novosibirsk, June 22–28, p. 147. http://www.bionet.nsc.ru/meeting/bgrs2008/BGRS2008_Proceedings.pdf |
| 154, Seliverstov A., Lyubetsky V., “RNA structures upstream the 2-isopropylmalate synthase encoding gene in alfa-proteobacteria and actinobacteria”
Abstracts of The Sixth International Conference on Bioinformatics of Genome Regulation and Structure (BGRS’2008), Novosibirsk, June 22–28, p. 144. http://www.bionet.nsc.ru/meeting/bgrs2008/BGRS2008_Proceedings.pdf |
| Gorbunov K., Kanovei V., Lyubetsky V., “Inferring optimal scenario of gene evolution along a species tree”
Abstracts of The Sixth International Conference on Bioinformatics of Genome Regulation and Structure (BGRS’2008), Novosibirsk, June 22–28, p. 90. http://www.bionet.nsc.ru/meeting/bgrs2008/BGRS2008_Proceedings.pdf |
| Rubanov L., Seliverstov A., Lyubetsky V., “Multiple alignment based on species tree”
Abstracts of The Sixth International Conference on Bioinformatics of Genome Regulation and Structure (BGRS’2008), Novosibirsk, June 22–28, p. 212. http://www.bionet.nsc.ru/meeting/bgrs2008/BGRS2008_Proceedings.pdf |
| Lyubetsky V., Zhizhina E., Rubanov L., “A model of regulatory signal evolution”
Abstracts of The Sixth International Conference on Bioinformatics of Genome Regulation and Structure (BGRS’2008), Novosibirsk, June 22–28, p. 148. http://www.bionet.nsc.ru/meeting/bgrs2008/BGRS2008_Proceedings.pdf |
| Glotova I., Lyubetsky V., ”Classical attenuation regulation model”
Abstracts of The Sixth International Conference on Bioinformatics of Genome Regulation and Structure (BGRS’2008), Novosibirsk, June 22–28, p. 85. http://www.bionet.nsc.ru/meeting/bgrs2008/BGRS2008_Proceedings.pdf |
| Lyubetsky V., “Models of gene expression regulation and evolution of regulatory elements” Proceeding of the Fifth International Conference of Applied Mathematics and Computing (Plovdiv, Bulgaria, August 12-18), 2008, pp. 17–19. |
| Любецкий В.А., Рубанов Л.И., Селиверстов А.В., «Выравнивание последовательностей на основе дерева» Труды 9-й Международной конференции РАН «Распознавание образов и анализ изображений: новые информационные технологии», 2008, 15-20 сентября, Нижний Новгород, сс. 137–140. |
| Friedman Sy-D., Kanovei V., Lyubetsky V., On ROD reducibility of equivalence relations in Solovay model,
Methods of Logic in Mathematics V,
Russian Academy of Sciences, Steklov Institute of Mathematics and Euler International Mathematical Institute, Proceedings of International Conference, St. Petersburg, Russia, June 1-7 2008, p. 6. |
| Любецкий В.А., Жижина Е.А., Рубанов Л.И., «Гиббсовский подход в задаче эволюции регуляторного сигнала экспрессии гена»
Проблемы передачи информации,
2008, т. 43, № 4, сс. 52–71. |
| Vitreschak A., Mironov A., Lyubetsky V., Gelfand M., “Comparative genomic analysis of T-box regulatory systems in bacteria”
Ribonucleic acids molecular biology (RNA),
V. 14, No. 4, April 2008, pp. 717-735.
PMID: 18359782 http://rnajournal.cshlp.org/content/14/4/717.full |
| Селиверстов А.В., Любецкий В.А., «О квадратичных формах, равных единице на большом множестве вершин n-мерного куба»
Информационные процессы,
2008, том 8, № 4, стр. 201–204. |
| Кановей В.Г., Любецкий В.А., Борелевская сводимость как аддитивное свойство областей,
Исследования по конструктивной математике и математической логике. XI,
Записки научных семинаров ПОМИ, том 358, СПб.: ПОМИ, 2008, 189–198. http://www.mathnet.ru/php/getFT.phtml?jrnid=znsl&paperid=2151&what=fullt&option_lang=rus |
2007 |
| Селиверстов А.В., Любецкий В.А., «Структура РНК перед геном 2-изопропилмалат синтазы у некоторых протеобактерий»
Информационные процессы,
2007. т. 7, № 1, сс. 113–115. http://www.jip.ru/2007/113-115-2007.pdf |
| Кановей В.Г., Любецкий В.А., Современная теория множеств: начала дескриптивной динамики,
Наука, 2007, 231 стр., Монография ISBN: 978-5-02-035577-4. http://www.ozon.ru/context/detail/id/3938505/ |
| Селиверстов А.В., Любецкий В.А., «Кластеризация и поиск промоторов у хлоропластов»
Труды 30-й конференции «Информационные технологии и системы» (ИТиС’07), Звенигород, 18–21 сентября 2007, стр. 321–323. |
| Глотова И., Рубанов Л.И., Селиверстов А.В., Любецкий В.А., «Псевдоузлы и РНК-триплексы в модели классической аттенюаторной регуляции» Труды конференции ИТиС 30, Звенигород, 18–21 сентября 2007, сс. 222-227. |
| Витрещак А.Г., Миронов А.А., Любецкий В.А., Гельфанд М.С., «Компьютерный анализ, функциональная аннотация и изучение эволюции Т-бокс регулона в бактериях» Труды конференции ИТиС 30, Звенигород, 18–21 сентября 2007, сс. 220-221. |
| Любецкий В.А., Жижина Е.А., Горбунов К.Ю., Селиверстов А.В., «Модель эволюции нуклеотидной последовательности» Труды конференции «Математические методы распознавания образов», 2007, сс. 605–609. |
| Seliverstov A., Lysenko E., Lyubetsky V., “Rapid evolution of promoters in Magnoliophyta chloroplasts” Proceedings of the international scientific conference “Computational Phylogenetics and Molecular Systematics, CPMS’2007”, November 16–19 2007, KMK Scientific Press, Moscow, pp. 286–292. |
| Vitreschak A., Lyubetsky V., Gelfand M., “Analysis of evolution of T-box regulatory elements prediction of amino acid transporters and other amino acid related genes” Proceedings of the international scientific conference “Computational Phylogenetics and Molecular Systematics, CPMS’2007”, November 16–19 2007, KMK Scientific Press, Moscow, pp. 30–37. |
| Rusin L., Lyubetsky V., “Algorithms to model gene evolution events and reconstruct multigene phylogenies of species”
Proceedings of the international conference “Computational Phylogenetics and Molecular Systematics, CPMS’2007”, Moscow, November 16–19 2007, KMK Scientific Press, P. 274–277. |
| Lyubetsky V., Seliverstov A., Gorbunov K., “Models of gene expression regulation and evolution of regulatory elements” Proceedings of the international scientific conference “Computational Phylogenetics and Molecular Systematics, CPMS’2007”, November 16–19 2007, KMK Scientific Press, Moscow, pp. 158–165. |
| Gorbunov K., Lyubetsky V., “Modeling evolution of the nucleotide sequence with secondary structure” Proceedings of the international scientific conference “Computational Phylogenetics and Molecular Systematics, CPMS’2007”, November 16–19 2007, KMK Scientific Press, Moscow, pp. 68–75. |
| Vitreschak A., Mironov A., Lyubetsky V., Gelfand M., “Function and evolutionary analysis of the T-box regulon in bacteria” Proceedings of International Moscow Conference on Computational Molecular Biology: МССМВ’07, November 2007, pp. 309–310. |
| Rusin L., Lyubetsky V., “Phylogenomics of Metazoa: Constructing the Gene Set” Proceedings of International Moscow Conference on Computational Molecular Biology: МССМВ’07, 2007, pp. 267–268. |
| Lyubetsky V., Seliverstov A., Zverkóv O., RNA Structures upstream leuA Genes in α-proteobacteria.
Proceedings of the International Moscow Conference on Computational Molecular Biology: MCCMB’07, Moscow, Russia, July 27–31 2007, P. 191–192. |
| Lyubetsky V., Seliverstov A., “Long helices in mRNA processing” Proceedings of International Moscow Conference on Computational Molecular Biology: МССМВ’07, 2007, pp. 189–191. |
| Gorbunov K., Radionov D., Laikova O., Gelfand M., Lyubetsky V., “Reconstruction of ancestral regulatory signal along a phylogeny” Proceedings of International Moscow Conference on Computational Molecular Biology: МССМВ’07, 2007, pp. 111–113. |
| Русин Л.Ю., Рубанов Л.И., Любецкий В.А., «Данные для построения эволюционного дерева высших Metazoa»
Информационные процессы,
2007, т. 7, № 3. сс. 199–213. |
| Кановей В.Г., Любецкий В.А., Борелевская сводимость сохраняется при счетном дизъюнктном объединении борелевских множеств,
Препринт Петербургского отделения Математического института РАН, 2007. http://www.pdmi.ras.ru/preprint/2007/07-16.html |
| Rubanov L., Lyubetsky V., “RNAmodel Web Server: Modeling Classic Attenuation in Bacteria”
In Silico Biology,
2007, V. 7, No 3, pp. 285–308.
PMID: 18415978 http://www.bioinfo.de/isb/2007/07/0044/ |
| Asarin E., Cachat Th., Seliverstov A., Touili T., Lyubetsky V., “Attenuation regulation as a term rewriting system” Article in the book “Algebraic Biology”, Lecture Notes in Computer Science 4545, Springer Berlin / Heidelberg, pp. 81–94, (Proceedings of the 2nd international conference on Algebraic biology: AB"07, Castle of Hagenberg, Austria, July 2-4 2007). http://arxiv.org/PS_cache/arxiv/pdf/0706/0706.2126v1.pdf |
| Горбунов К.Ю., Любецкий В.А., «Реконструкция предковых регуляторных сигналов вдоль дерева эволюции фактора транскрипции»
Молекулярная биология,
2007, том 41, № 5, стр. 918–925. |
| Любецкая Е.В., Селиверстов А.В., Любецкий В.А., «У актинобактерий число длинных шпилек в межгенных трейлерных областях велико по сравнению с другими областями генома»
Молекулярная биология,
2007, том 41, № 4, стр. 739–742. |
| Селиверстов А.В., Любецкий В.А., «Регуляция биосинтеза пролина у протеобактерий»
Молекулярная биология,
2007, том 41, № 3, стр. 572–574. |
| Кановей В.Г., Любецкий В.А., Проблемы теоретико-множественного нестандартного анализа,
Успехи математических наук,
2007, 62:1(373), сс. 51–122. http://www.mathnet.ru/php/getFT.phtml?jrnid=rm&paperid=5588&what=fullt&option_lang=rus |
| Кановей В.Г., Любецкий В.А., Реекен М., О сводимости монадических отношений эквивалентности,
Математические заметки,
2007, т. 81, № 6, сс. 842–854. http://www.mathnet.ru/links/4511ac41dc80f2435c1b79658aa17116/mzm3735.pdf |
| Любецкий В.А., Пирогов С.А., «Нестандартные представления локально компактных групп»
Математические заметки,
2007, 82, 3, сс. 383–389. http://www.springerlink.com/content/bj210202g2448945/fulltext.pdf |
| Lyubetsky V., Pirogov S., Rubanov L., Seliverstov A., “Modeling classic attenuation regulation of gene expression in bacteria”
Journal of Bioinformatics and Computational Biology,
Vol. 5, Iss. 1, 2007, pp. 155–180.
PMID: 17477496 |
2006 |
| Кановей В.Г., Любецкий В.А., Конфинальное семейство отношений эквивалентности
и порождающих их борелевских идеалов.
Труды МИАН, 2006, 252, с. 94--113.
http://mi.mathnet.ru/tm65 |
| Seliverstov A., Zverkóv O., Lyubetsky V., Translation of some chloroplast genes is checked to allow for splicing and editing.
Biophysics. 2006, Vol. 51, Suppl. 1, P. S18–S22.
DOI: 10.1134/S0006350906070049 http://www.springerlink.com/content/p7517k3187230111/ |
| Lyubetsky V., Seliverstov A., “Modeling classic attenuation regulation of gene expression in bacteria”
Proceedings of The Fifth International Conference on Bioinformatics of Genome Regulation and Structure (BGRS’2006), Novosibirsk, July 16–22 2006, V. 1, pp. 102–105. http://www.bionet.nsc.ru/meeting/bgrs_proceedings/papers/2006/BGRS_2006_V1_022.pdf |
| Rusin L., Lyubetsky V., “Refinement of phylogenetic signal in multiple sequence alignment: results of simulation study”
Proceedings of the Fifth International Conference on Bioinformatics of Genome Regulation and Structure (BGRS"2006), Novosibirsk, Russia, July 16–22 2006, Vol. 3, P. 222–224. http://www.bionet.nsc.ru/meeting/bgrs_proceedings/papers/2006/BGRS_2006_V3_049.pdf |
| Gorbunov K., Lyubetsky V., “Inferring regulatiory signal profiles and evolutionary events”
Proceedings of the Fifth International Conference on Bioinformatics of Genome Regulation and Structure (BGRS"2006), Novosibirsk, Russia, July 16–22 2006, Vol. 3, P. 151–154. http://www.bionet.nsc.ru/meeting/bgrs_proceedings/papers/2006/BGRS_2006_V3_031.pdf |
| Lyubetskaya E., Seliverstov A., Lyubetsky V., “Detecting Hairpins in 3’-Untranslated Regions of Highly Expressed Genes in Actinobacteria”
Proceedings of The Fifth International Conference on Bioinformatics of Genome Regulation and Structure (BGRS’2006), Novosibirsk, July 16–22 2006, V. 1, pp. 99–101. http://www.bionet.nsc.ru/meeting/bgrs_proceedings/papers/2006/BGRS_2006_V1_021.pdf |
| Vitreschak A., Lyubetsky V., Gelfand M., “Evolutional and Functional Analysis of T-box Regulon in Bacteria: Identification of new Genes Involved in Amino Acid Metabolism”
Proceedings of The Fifth International Conference on Bioinformatics of Genome Regulation and Structure (BGRS’2006), Novosibirsk, July 16–22 2006, V. 3, pp. 236–240. http://www.bionet.nsc.ru/meeting/bgrs_proceedings/papers/2006/BGRS_2006_V3_053.pdf |
| Seliverstov A., Lyubetsky V., “Translation Regulation in Chloroplasts”
Proceedings of The Fifth International Conference on Bioinformatics of Genome Regulation and Structure (BGRS’2006), Novosibirsk, July 16–22 2006, V. 1, pp. 146–149. http://www.bionet.nsc.ru/meeting/bgrs_proceedings/papers/2006/BGRS_2006_V1_033.pdf |
| Кановей В.Г., Любецкий В.А., «Конфинальное семейство отношений эквивалентности и порождающих их борелевских идеалов»
Труды Математического института имени В.А. Стеклова,
Труды МИАН,
2006, т. 252, № 1, сс. 94–113. http://dx.doi.org/10.1134/S008154380601010X |
| Любецкий В.А., Рубанов Л.И., Селиверстов А.В., Пирогов С.А., «Модель регуляции экспрессии генов у бактерий на основе формирования вторичных структур РНК»
Молекулярная биология,
2006, т. 40, № 3, сс. 497–511. |
| Любецкий В.А., Селиверстов А.В., «Вычисление эффективности регуляции биосинтеза триптофана у бактерий на основе модели классической аттенюации» Информационные процессы, 2006, т. 6, № 1, сс. 55–57. http://www.jip.ru/2006/55-57-2006.pdf |
| Селиверстов А.В., Любецкий В.А., «Алгоритм поиска консервативных участков нуклеотидных последовательностей» Информационные процессы, 2006, т. 6, № 1, сс. 33–36. http://www.jip.ru/2006/33-36-2006.pdf |
| Леонтьев Л.А., Любецкий В.А., «Алгоритм определения белка, согласованного с заданным филогенетическим профилем» Информационные процессы, 2006, т. 6, № 1, сс. 24–32. |
| Леонтьев Л.А., Любецкий В.А., «Массовый поиск консервативных регуляторных структур, содержащих Т-боксы: результаты счета» Информационные процессы, 2006, т. 6, № 1, сс. 20–23. |
| Seliverstov A., Lyubetsky V., “Translation Regulation of Intron-containing Genes in Chloroplasts”
Journal of Bioinformatics and Computational Biology,
2006, Vol. 4, No. 4, P. 783–792.
PMID: 17007067 |
| Lyubetsky V., Gorbunov K., Rusin L., V'yugin V., “Algorithms to reconstruct evolutionary events at molecular level and infer species phylogeny” An article in the book: “Bioinformatics of Genome Regulation and Structure II”, Springer Science & Business Media, Inc. 2006, pp. 189–204. http://www.springerlink.com/content/q67568k37g687647/ |
| Любецкая Е.В., Рубанов Л.И., Селиверстов А.В., Любецкий В.А., "Алгоритм поиска мощных вторичных структур в нуклеотидной последовательности и его применение для подсчета числа таких структур в разных областях геномов". Информационные процессы, том 6, № 3, 2006, с.258-263 http://www.jip.ru/2006/258-263-2006.pdf |
2005 |
| Кановей В.Г., Любецкий В.А., О совершенных подмножествах инвариантных СА-множеств.
Математические заметки, 2005, 77, 3, с. 334--338
http://mi.mathnet.ru/mz2496 |
| Kanovei V., Lyubetsky V., A cofinal family of equivalence relations generated by Borel ideals.
Logic Colloquium 2005.
ASL European Summer meeting. July 28 -- August 3,
Athens, Greece, pp. 83.
Department of Mathematics, University of Athens, Greece, 2005.
|
| Rusin L., V'yugin V., Lyubetsky V., “Phylogenetic signal vs. informational noise: combat for resolution”
Proceedings of the international conference “9th Evolutionary Biology Meeting”, Marseille, France, September 21–23 2005. |
| Rusin L., V'yugin V., Lyubetsky V., “A method to optimize primary sequence data for enhanced tree resolution”
Proceedings of the 4th European Conference on Computational Biology ECCB 2005, Madrid, Spain, September 28 – October 01 2005. |
| Любецкий В.А., «Математические модели эволюции и регуляции экспрессии генов» Труды конференции РАН «Математические методы распознавания образов», 2005, Москва, сс. 366–368. |
| Леонтьев Л.А., Селиверстов А.В., Любецкий В.А., «Регуляция транскрипции с участием Т-боксов» Труды конференции РАН «Проблемы управления и моделирования в сложных системах, VII Международная конференция», 2005, Самара, сс. 222–224. |
| Любецкий В.А., Селиверстов А.В., «Регуляция трансляции у Актинобактерий и Цианобактерий с участием вторичных структур мРНК» Труды конференции РАН «Проблемы управления и моделирования в сложных системах, VII Международная конференция», 2005, Самара, сс. 216–221. |
| Пирогов С.А., Горбунов К.Ю., Любецкий В.А., «Макро- и микросостояния в модели аттенюаторной регуляции экспрессии генов у бактерий» Труды конференции РАН «Проблемы управления и моделирования в сложных системах, VII Международная конференция», 2005, Самара, сс. 210–215. |
| Любецкий В.А., Пирогов С.А., «Модель аттенюаторной регуляции у бактерий» Труды конференции РАН «Проблемы управления и моделирования в сложных системах, VII Международная конференция», 2005, Самара, сс. 205–209. |
| Leont'yev L., Seliverstov A., Lyubetsky V., “An algorithm for mass searching of T-box structures in bacteria” MCCMB’05, 2005, pp. 202–206. |
| Lyubetsky V., V'yugin V., “A model for evolutionary event reconstruction” MCCMB’05, 2005, pp. 217–219. |
| Rusin L., V'yugin V., Lyubetsky V., “Enhancing phylogenetic inference: concentration of the signal in sequence data” MCCMB’05, 2005, pp. 342–346. |
| Gorbunov K., Lyubetsky V., “Algorithms to reconstruct ancestral gene evolution events” MCCMB’05, 2005, pp. 128–129. |
| Lyubetsky V., Seliverstov A., “RNA regulatory structures in Actinobacteria and Cyanobacteri” MCCMB’05, 2005, pp. 351–353. |
| Lyubetsky V., Pirogov S., “A model for bacterial gene expression regulation with secondary RNA structures” MCCMB’05, 2005, pp. 214–216. |
| Селиверстов А.В., Любецкий В.А., «Регуляция трансляции в хлоропластах» Информационные процессы, 2005, т. 5, № 5, сс. 400–404. http://www.jip.ru/2005/400-404.pdf |
| Любецкий В.А., Селиверстов А.В., «Поиск консервативных участков в лидерных областях генов в случае известного дерева видов» Информационные процессы, 2005, т. 5, No 4, сс. 265–270. http://www.jip.ru/2005/265-270.pdf |
| Любецкий В.А., Горбунов К.Ю., Вьюгин В.В., Русин Л.Ю., «Удаление шума в множественном выравнивании белковых последовательностей» Информационные процессы, 2005, т. 5, № 5, сс. 380–391. http://www.jip.ru/2005/380-391.pdf |
| Любецкий В.А., Горбунов К.Ю., Пирогов С.А., Рубанов Л.И., Селиверстов А.В., «Алгоритм и результаты счета для модели регуляции экспрессии генов у бактерий на основе формирования вторичных структур РНК» Информационные процессы, 2005, т. 5, № 5, сс. 337–366. http://www.jip.ru/2005/337-366.pdf |
| Леонтьев Л.А., Любецкий В.А., Селиверстов А.В., «Алгоритм массового поиска опосредованной Т-боксом транскрипционной регуляции у бактерий»
Молекулярная биология,
2005, т. 39, № 6, сс. 1076–1078.
PMID: 16358746 |
| Любецкий В.А., Селиверстов А.В., «Регуляция экспрессии генов биосинтеза аминокислот и аминоацил-тРНК-синтетаз у актинобактерий»
Молекулярная биология,
2005, том 39, № 6, стр. 1072–1075.
PMID: 16358745 |
| Seliverstov A., Putzer H., Gelfand M., Lyubetsky V., “Comparative analysis of RNA regulatory elements of amino acid metabolism genes in Actinobacteria”
BMC Microbiology,
2005, 5:54.
PMID: 16202131 http://www.biomedcentral.com/1471-2180/5/54 |
| Горбунов К.Ю., Любецкий В.А., «Поиск предковых генов, нарушающих согласованность деревьев белков и видов»
Молекулярная биология,
2005, т. 39, № 5, сс. 847–858.
PMID: 16240718 |
| Кановей В.Г., Любецкий В.А., «О совершенных подмножествах инвариантных CA-множеств»
Математические заметки,
2005, том 77, № 3, стр. 334–338. http://www.springerlink.com/content/hx77t845227524g5/fulltext.pdf |
| Kanovey V., Lyubetsky V., “A cofinal family of equivalence relations generated by Borel ideals” Conference of Association for Symbolic Logic, Greece, Logic Colloquium 2005, ASL European Summer Meeting, July 28 – August 2, Athens, Greece, University of Athens, Greece, pp. 83. |
2004 |
| Любецкий В.А., Селиверстов А.В., «Note on Cliques and Alignments»
Информационные процессы,
2004, том 4, № 3, стр. 241–246. http://www.jip.ru/2004/241-246.pdf |
| Lyubetsky V., Gorbunov K., V'yugin V., “Inferring evolutionary events, quality of COGs, measuring the dissimilarity between gene and species trees” Presentation abstracts of the EMBO World Phylogenetic Course 2004. November 1–7 2004, Rio de Janeiro, Brazil. |
| Lyubetsky V., V'yugin V., “Complex phylogenetic analysis of the evolutionary history for some prokaryotes family”
Biophysics (Moscow),
2004, V. 48, Suppl. 1 (2003), pp. 97–106. |
| Gorbunov K., Lyubetsky V., “New approach for detecting common secondary structures in a set of RNA sequences”
Biophysics (Moscow),
2004, V. 48, Suppl. 1 (2003), pp. 56–67. |
| Селиверстов А.В., Любецкий В.А., «Особенности синтеза цистеина у Corynebacterium, Mycobacterium и Propionibacterium» Информационные процессы, 2004, т. 4, № 3, сс. 247–250. http://www.jip.ru/2004/247-250.pdf |
| Кановей В.Г., Любецкий В.А., О множестве конструктивных вещественных чисел,
Геометрическая топология и теория множеств,
Труды МИАН, том 247, М.: Наука, 2004, сс. 95–128. http://mi.mathnet.ru/tm12 |
| Любецкий В.А., Селиверстов А.В., «Многодольные графы с двумя вершинами в каждой доле» Информационные процессы, 2004, т. 4, № 2, сс. 127–132. http://www.jip.ru/2004/127-132.pdf |
| Любецкий В.А., «Основные понятия элементарной математики» Рекомендовано в качестве учебного пособия для университетов и пединститутов, 2004, Айрис-пресс, 625 страниц. http://www.ozon.ru/context/detail/id/2194434/ |
| Кузнецов Н.А., Гельфанд М.С., Любецкий В.А., «Биоинформатика бактерий – основные задачи и характер моделей» Труды 6-й международной конференции «Проблемы управления и моделирования в сложных системах», 14–17 июня 2004, РАН, сс. 5–11. |
| Любецкая Е.В., Леонтьев Л.А., Ширшин М.А., Любецкий В.А., «Алгоритм поиска сигнала со сложной структурой» Труды 6-й международной конференции «Проблемы управления и моделирования в сложных системах», 14–17 июня 2004, РАН, сс. 158–162. |
| Любецкий В.А., Селиверстов А.В., «Геометрический метод поиска клики в графе и его применение для выделения сигнала» Труды 6-й международной конференции «Проблемы управления и моделирования в сложных системах», 14–17 июня 2004, РАН, сс. 154–157. |
| Горбунов К.Ю., Любецкий В.А., «Модель регуляции биосинтеза» Труды 6-й международной конференции «Проблемы управления и моделирования в сложных системах», 14–17 июня 2004, РАН, сс. 151–153. |
| Lyubetsky V., V'yugin V., “Measuring the Dissimilarity Between Gene and Species Trees, the Quality of a COG”
Proceedings of the Fourth International Conference on Bionnformatics of Genome Regulation and Structure (BGRS’2004), Novosibirsk, July 25–30 2004, V. 2, pp. 281–284. http://www.bionet.nsc.ru/meeting/bgrs_proceedings/papers/2004/BGRS_2004_V2_069.pdf |
| Gorbunov K., Lyubetsky V., “A Model of Tryptophan Biosynthesis Regulation”
Proceedings of the Fourth International Conference on Bionnformatics of Genome Regulation and Structure (BGRS’2004), Novosibirsk, July 25–30 2004, V. 2, pp. 53–55. http://www.bionet.nsc.ru/meeting/bgrs_proceedings/papers/2004/BGRS_2004_V2_011.pdf |
| Lyubetsky V., Seliverstov A., ”Amino Acid Biosynthesis Attenuation in Bacteria“
Proceedings of the Fourth International Conference on Bionnformatics of Genome Regulation and Structure (BGRS’2004), Novosibirsk, July 25–30 2004, V. 1, pp. 307–310. http://www.bionet.nsc.ru/meeting/bgrs_proceedings/papers/2004/BGRS_2004_V1_077.pdf |
| Leont'yev L., Shirshin M., Lyubetsky V., “Detection of Classical Attenuation in Bacterial Genomes”
Proceedings of the Fourth International Conference on Bionnformatics of Genome Regulation and Structure (BGRS’2004), Novosibirsk, July 25–30 2004, V. 1, pp. 116–118. http://www.bionet.nsc.ru/meeting/bgrs_proceedings/papers/2004/BGRS_2004_V1_028.pdf |
| Vitreschak A., Lyubetskaya E., Shirshin M., Gelfand M., Lyubetsky V., “Attenuation regulation of amino acid biosynthetic operons in proteobacteria: comparative genomics analysis”
FEMS Microbiological Letters,
2004, 234(2), pp. 357–370.
PMID: 15135544 http://www.sciencedirect.com/science?_ob=ArticleURL&_udi=B6T2W-4C5VMJK-4&_user=10&_rdoc=1&_fmt=&_ori |
| Кузнецов Н.А., Любецкий В.А., Чернавский А.В., «К вопросу о понятии информационного взаимодействия, 3: речевой интеллект» Информационные процессы, 2004, т. 4, № 2, сс. 117–126. http://www.jip.ru/2004/117-126.pdf |
2003 |
| Кановей В.Г., Любецкий В.А., О некоторых классических проблемах дескриптивной теории множеств.
УМН, 2003, 58, 5, c. 3--88. http://www.mathnet.ru/php/archive.phtml?wshow=paper&jrnid=rm&paperid=666&option_lang=rus |
| Гельфанд М.С., Любецкий В.А., «Биоинформатика: от эксперимента к компьютерному анализу и снова к эксперименту»
Вестник РАН,
2003, том 73, № 11, стр. 987–994. http://vivovoco.rsl.ru/VV/JOURNAL/VRAN/GENOMICS/GENOMICS.HTM |
| Кановей В.Г., Любецкий В.А., О существовании регулярного неопределимого множества вещественных чисел,
Труды конференции «Колмогоров и современная математика (100 лет Колмогорову)», Москва, 2003, стр. 690. |
| Lyubetskaya E., Leont'yev L., Lyubetsky V., “Algorithm for detecting alternative secondary RNA structures and mass analysis attenuator regulation in proteobacteria” MCCMB’03, 2003, pp. 144–145. |
| Любецкая Е.В., Леонтьев Л.А., Любецкий В.А., «Поиск альтернативных вторичных структур в классе гамма-протеобактерий» Информационные процессы, том 3, № 1, 2003, сс. 23–38. |
| Любецкая Е.В., Леонтьев Л.А., Гельфанд М.С., Любецкий В.А., «Поиск альтернативных вторичных структур РНК, регулирующих экспрессию бактериальных генов»
Молекулярная биология,
том 37, № 5, 2003, сс. 834–842.
PMID 14593920 |
| Голубцов П.В., Любецкий В.А., «Информационная структура динамических игр и объем доступной игрокам информации»
Логические исследования РАН,
2003, сс. 36–47. |
| Кузнецов Н.А., Любецкий В.А., Чернавский А.В., «О понятии информационного взаимодействия, 2: допсихический уровень» Информационные процессы, том 3, № 2, 2003, сс.154-172. http://www.jip.ru/2003/3-2-2003.htm |
| Кановей В.Г., Любецкий В.А., «О некоторых классических проблемах дескриптивной теории множеств»
Успехи математических наук,
т. 58, № 5, 2003, сс. 3–88. |
| Lyubetsky V., V'yugin V., “Complex phylogenetic analysis of evolutionary history for prokaryotes families” MCCMB’03, 2003, pp. 146–147. |
| Gorbunov K., Lyubetsky V., “Detecting common secondary structures in a set of RNA sequences and its testing” MCCMB’03, 2003, pp. 83–85. |
| Danilova L., Lyubetsky V., Laikova O., “Computer detecting of glycerol-3-phosphate metabolism regulation in proteobacterial genomes” MCCMB’03, 2003, pp. 52–53. |
| Гельфанд М.С., Любецкий В.А., «ДНК: от молекулы до генома, от биохимических озарений к алгоритмическому анализу»
Вестник РАН,
№ 11, 2003, сс. 963–970. |
| Кановей В.Г., Любецкий В.А., «Классические проблемы дескриптивной теории множеств» Труды 4-й международной Смирновской конференции, РАН, Москва, 2003, сс. 32–34. |
| Голубцов П.В., Любецкий В.А., «Результат информационного процесса зависит от характера и объёма доступной его участникам информации» Международная конференция РАН, Самара, 2003, сс. 445–453. |
| Горбунов К.Ю., Любецкий В.А., Миронов А.А., «Поиск консервативной вторичной структуры РНК»
Молекулярная биология,
том 37, № 5, 2003, сс. 850–860.
PMID 14593922 |
| Кузнецов Н.А., Любецкий В.А., Чернавский А.В., «О понятии информационного взаимодействия, 1: допсихический уровень» Информационные процессы, том 3, № 1, 2003, сс. 1–22. |
| Любецкий В.А., Горбунов К.Ю., «Поиск консервативных вторичных структур РНК» Информационные процессы, том 3, № 1, 2003, сс. 47–60. |
| Данилова Л.В., Гельфанд М.С., Любецкий В.А., Лайкова О.Н., «Компьютерный анализ регуляции метаболизма глицерол-3-фосфата в геномах протеобактерий»
Молекулярная биология,
2003, т. 37, № 5. сс. 843–849.
PMID 14593921 |
| Вьюгин В.В., Гельфанд М.С., Любецкий В.А., «Идентификация горизонтально перенесенных генов на основе филогенетических данных»
Молекулярная биология,
том 37, № 4, 2003, сс. 674–687.
PMID 12942641 |
| Danilova L., Lyubetsky V., Gelfand M., “An algorithm for identification of regulatory signals in unaligned DNA sequences, its testing and parallel implementation”
In Silico Biology,
V. 3, No 1,2, 2003, pp. 33–47.
PMID 12762844 http://www.bioinfo.de/isb/2003/03/0004 |
| Lyubetsky V., V'yugin V., “Methods of horizontal gene transfer determination using phylogenetic data”
In Silico Biology,
V. 3, No 1,2, 2003, pp. 17–31.
PMID 12762843 http://www.bioinfo.de/isb/2003/03/0003 |
| Голубцов П.В., Любецкий В.А., «Стохастические динамические игры с информацией различного типа»
Проблемы передачи информации,
2003, том 39, вып. 3, сс. 40–71. |
| Любецкий В.А., Селиверстов А.В., «Некоторые алгоритмы, связанные с конечными группами» Информационные процессы, том 3, № 1, 2003, сс. 39–46. http://www.jip.ru/2003/LS%2039-46.pdf |
2002 |
| Леонтьев Л.А., Любецкая Е.В., Любецкий В.А., «Модифицированный алгоритм поиска альтернативных вторичных структур РНК и результаты счета» Информационные процессы, 2002, том 2, № 1, сс. 100–105. |
| Вьюгин В.В., Гельфанд М.С., Любецкий В.А., «Согласование деревьев: реконструкция эволюции видов по филогенетическим деревьям генов»
Молекулярная биология,
2002, т. 36, № 5, сс. 807–816.
PMID 12391844 |
| Lyubetsky V., Rubanov L., “Parallel Algorithm for Searching Regulatory Signal in Bacterial Genome”
Proceedings of the Third International Conference of Bioinformatics of Genome Regulation and Structure (BGRS’2002), Novosibirsk, Russia, July 14-20, 2002, v. 1, p. 24-27. http://www.bionet.nsc.ru/meeting/bgrs_proceedings/papers/2002/BGRS_2002_1_005.pdf |
| Gorbunov K., Lyubetsky V., “An Algorithm for Searching for Common Secondary Structures in a Set of RNA Sequences”
Proceedings of The Third International Conference on Bioinformatics of Genome Regulation and Structure (BGRS’2002), Novosibirsk, Russia, July 14–20, 2002, V. 3, pp. 20–22. http://www.bionet.nsc.ru/meeting/bgrs_proceedings/papers/2002/BGRS_2002_3_004.pdf |
| Lyubetskaya E., Lyubetsky V., “Algorithm for Searching for Alternative Secondary RNA Structures”
Proceedings of The Third International Conference on Bioinformatics of Genome Regulation and Structure (BGRS’2002), Novosibirsk, Russia, July 14–20, 2002, V. 3, pp. 14–20. http://www.bionet.nsc.ru/meeting/bgrs_proceedings/papers/2002/BGRS_2002_3_002.pdf |
| Lyubetsky V., V'yugin V., “Method of Horizontal Gene Transfer Determination Using Phylogenetic Data”
Proceedings of The Third International Conference on Bioinformatics of Genome Regulation and Structure (BGRS’2002), Novosibirsk, Russia, July 14–20, 2002, V. 2, pp. 61–63. http://www.bionet.nsc.ru/meeting/bgrs_proceedings/papers/2002/BGRS_2002_2_019.pdf |
| Кузнецов Н.А., Любецкий В.А., Чернавский А.В., «К вопросу о понятии информационного взаимодействия, 3: речевой интеллект» Труды 4-ой Международной конференции РАН «Проблемы управления и моделирования в сложных системах», 17–23 июня 2002, Самара, сс. 7–17. |
| Вьюгин В.В., Любецкий В.А., «О некоторых способах отбора горизонтально перенесенных генов на основе филогенетических данных» Информационные процессы, 2002, том 2, № 1, сс. 120–140. |
| Горбунов К.Ю., Любецкий В.А., «Алгоритм поиска консервативных вторичных структур в наборе фрагментов РНК» Информационные процессы, 2002, том 2, № 1, сс. 55–58. |
2001 |
| Горбунов К.Ю., Любецкая Е.В., Любецкий В.А., «О двух алгоритмах поиска альтернативной вторичной структуры РНК» Информационные процессы, том 1, № 2, 2001, сс. 178–187. |
| Lyubetsky V., “First projective sets, AE-prefix and quantifiers elimination” Abstracts of International conference on Mathematical Logic, Algebra and Set theory dedicated to the 100-th anniversary of P.S. Novikov, August 27–31 2001, Steklov Mathematical Institute RAS, Moscow, 2001, p. 27. |
| Кузнецов Н.А., Любецкий В.А., Чернавский А.В., «К вопросу о понятии информационного взаимодействия, 2: доречевой интеллект» Труды 3-ей международной конференции «Проблемы управления и моделирования в сложных системах», Самара, РАН, 2001, сс. 25–42. |
| Данилова Л.В., Любецкий В.А., «Алгоритм выделения регуляторных сигналов: тестирование и биологические применения» Труды 3-ей международной конференции «Проблемы управления и моделирования в сложных системах», Самара, РАН, 2001, сс. 632–634. |
| Любецкий В.А., Селиверстов А.В., «Об одном вероятностном алгоритме решения NP-полной проблемы» Труды третьей международной конференции «Смирновские чтения», РАН, Москва, 2001, сс. 47–49. |
| Вьюгин В.В., Любецкий В.А., «Об одном алгоритме поиска горизонтального переноса гена на основе филогенетических деревьев белков»
Информационные процессы,
2001, том 1, № 2, стр. 167–177. |
| Данилова Л.В., Горбунов К.Ю., Гельфанд М.С., Любецкий В.А., «Алгоритм выделения регуляторных сигналов в последовательностях ДНК»
Молекулярная биология,
том 35, № 6, 2001, сс. 987–995.
PMID 11771146 |
| Гельфанд М.С., Вьюгин В.В., Любецкий В.А., «Об одном способе построения деревьев эволюции видов по множественным генетическим данным» Информационные процессы, том 1, № 1, 2001, сс. 64–77. |
| Данилова Л.В., Горбунов К.Ю., Гельфанд М.С., Любецкий В.А., «Алгоритм выделения регуляторных сигналов в последовательностях ДНК» Информационные процессы, том 1, № 1, 2001, сс. 56–63. |
| Зарелуа А.В., Любецкий В.А., Предисловие редакторов ко 2-му тому книги А. Маллиос «Геометрия векторных пучков», Мир, 2001 (442 страницы). |
2000 |
| Lyubetsky V., Larijani M.J.A., “Topics in Classical and Intuitionistic Model Theory”
Gardariki, Moscow, 2000, 390 pages.
Monograph |
| Зарелуа А.В., Любецкий В.А., Предисловие редакторов к 1-му тому книги А. Маллиос «Геометрия векторных пучков», Мир, 2000 (460 страниц). |
| Верещагин Н.К., Любецкий В.А., «Алгоритм определения вторичной структуры РНК»
Труды научно-исследовательского семинара логического центра ИФ РАН,
выпуск 14, Москва, Издательство РАН, 2000, сс. 99–109. |
| Горбунов К.Ю., Любецкий В.А., «Об алгоритме выявления регуляторного сигнала в наборе последовательностей»
Логические исследования,
выпуск 7, Москва, Наука, 2000, сс. 159–163. |
| Вьюгин В.В., Горбунов К.Ю., Любецкий В.А., «Алгоритмы выделения регуляторного сигнала и построения эволюционных деревьев» Труды 2-ой международной конференции «Проблемы управления и моделирования в сложных системах», Самара, Издательство РАН, 2000, сс. 130–137. |
| Кузнецов Н.А., Любецкий В.А., А.В. Чернавский, «К вопросу о понятии информационного взаимодействия, 1: допсихическая биоинформатика» Труды 2-ой международной конференции «Проблемы управления и моделирования в сложных системах», Самара, Издательство РАН, 2000, сс. 8–20. |
1999 |
| Кузнецов Н.А., Любецкий В.А., «Компьютерная логика в информационных процессах»
Проблемы передачи информации,
1999, том 35, вып. 2, сс. 107–111. http://mi.mathnet.ru/rus/ppi/v35/i2/p107 |
| Любецкий В.А., «Логические модели процессов информационного взаимодействия» Труды 1-ой международной конференции РАН «Проблемы управления и моделирования в сложных системах», Самара, 1999, сс. 133–145. |
| Любецкий В.А., «Об основах интеллектуальных процессов» Труды второго философского конгресса, Екатеринбург, часть 1, 1999, сс. 223–224. |
| Любецкий В.А., «О преобразовании классических выводов в интуиционистские» Труды второй международной конференции «Смирновские чтения», Москва, 1999, сс. 38–41. |
| Любецкий В.А., «Логика устной речи в сравнении с логикой письменной речи» Труды второго философского конгресса, Екатеринбург, 1999, часть 1, с. 222. |
1997 |
| Любецкий В.А., Любецкая С.Н., «О некоторых задачах эффективизации и целенаправленного поведения»,
Логические исследования,
М.: Наука, 1997, вып. 4, стр. 180. |
| Любецкий В.А., «Теоремы переноса и интуиционистская теория множеств»
Доклады РАН,
1997, т. 357, № 2, сс. 168–171. |
| Любецкий В.А., «Теоремы переноса и алгебра модальных операторов, III»
Алгебра и Логика (СО АН СССР),
1997, т. 36, № 3, сс. 282–303. http://www.springerlink.com/content/t6335872j077x161/ |
1996 |
| Любецкий В.А., «О некоторых применениях метода семантического оценивания»
Проблемы передачи информации,
1996, т. 32, № 3, сс. 82–96. http://mi.mathnet.ru/rus/ppi/v32/i3/p82 |
1995 |
| Любецкий В.А., «Теоремы переноса и алгебра модальных операторов, II»
Логические исследования,
РАН, 1995, № 3, Наука, Москва, сс. 205–232. |
1993 |
| Любецкий В.А., «Об одном подходе к моделированию интеллектуальных систем»
Проблемы передачи информации,
1993, т. 29, № 3, сс. 107–109. http://mi.mathnet.ru/rus/ppi/v29/i3/p107 |
1992 |
| Любецкий В.А., «Локально аксиоматизируемые классы колец, II»
The Journal of Symbolic Logic,
1992, vol. 57, № 1, p. 377. |
| Lyubetsky V., “Heyting-Valued Analysis: P. S. Novikov’s Hypotheses”
Contemporary Mathematics,
1993, V. 131, Pt. 3, PP. 565–583. |
1991 |
| Любецкий В.А., «Гейтинговозначный анализ: гипотеза П.С. Новикова»
The Journal of Symbolic Logic,
1991, vol. 56, № 3, p. 1131. |
| Любецкий В.А., «Перевод выводимости в классической теории множеств в интуиционистскую теорию множеств для языка колец»
Алгебра и Логика (СО АН СССР),
Новосибирск, 1991, т. 30, № 6, сс. 652–670. http://www.springerlink.com/content/v7n82v773n44h430/ |
| Любецкий В.А., «Интуиционистская теория алгебраических систем и нестандартный анализ»
Алгебра и Логика (СО АН СССР),
Новосибирск, 1991, т. 30, № 3, сс. 320–333. http://www.springerlink.com/content/q8056m2630165072/ |
1990 |
| Любецкий В.А., «Гейтинговозначный анализ: гипотеза П.С. Новикова»
в книге «Основания неклассических логик»,
М.: АН СССР, 1990, стр. 105–119. |
| Любецкий В.А., «Модельная полнота теории и оценки формул»
Алгебра и Логика (СО АН СССР),
Новосибирск, 1990, т. 29, № 1, сс. 15–28. http://www.springerlink.com/content/jw471283h3tqh831/ |
1989 |
| Любецкий В.А., «Оценки и пучки. О некоторых вопросах нестандартного анализа»
Успехи математических наук,
1989, т. 44, № 4 (268), сс. 99–153. http://mi.mathnet.ru/rus/umn/v44/i4/p99 |
1988 |
| Lyubetsky V., “On some applications of Heyting-valued analysis II”
Article in the book COLOG-88, Lecture Notes in Computer Science, Vol. 417, Springer, 1990, P. 122–145, Proceedings of the International Conference on Computer Logic, Tallinn, USSR, December 12–16 1988 |
1987 |
| Любецкий В.А., «Основные понятия школьной математики» Просвещение, Москва, 1987, 600 страниц, Допущено Министерством образования в качестве учебного пособия, ISBN 103-03-87. http://www.ozon.ru/context/detail/id/4518411/ |
1986 |
| Любецкий В.А., «Некоторые применения теории топосов к изучению алгебраических систем»,
дополнение к книге: П.T. Джонстон «Теория топосов», М.: Наука, 1986, стр. 376–433. |
1985 |
| Любецкий В.А., «О некоторых алгебраических проблемах нестандартного анализа»
Доклады АН СССР,
1985, т. 280, № 1. |
1983 |
| Любецкий В.А., Гордон Е.И., «Вложение пучков в гейтинговозначный универсум»
Доклады АН СССР,
1983, т. 268, № 4. |
| Любецкий В.А., Гордон Е.И., «Булевы расширения равномерных структур» В книге: «Исследования по неклассическим логикам и формальным системам», Наука, 1983, сс. 82–153. |
1981 |
| Любецкий В.А., другие, «Об одной модели взаимодействия тундровой растительности с абиотическим окружением»
в книге: «Проблемы экологического мониторинга и моделирования экосистем», Гидрометеорология, 1981, т. 4. |
| Любецкий В.А., Гордон Е.И., «Некоторые применения нестандартного анализа в теории булевозначных мер»
Доклады АН СССР,
1981, т. 256, № 5, сс. 1037–1041. |
1976 |
| Любецкий В.А., «Дискретная математика» Издательство МО, Москва, 1976, 175 страниц, Допущено в качестве учебного пособия, ISBN G-917017-89. |
| Любецкий В.А., «Случайные последовательности вещественных чисел и А2 множества» В книге: «Исследования по теории множеств и неклассическим логикам», Наука, Москва, 1976, сс. 96–122. |
1971 |
| Любецкий В.А., «Независимость некоторых предложений дескриптивной теории множеств от теории множеств Цермело-Френкеля»
Вестник Московского университета,
1971, № 2, сс. 78–82, издательство МГУ. |
| Любецкий В.А., «Определимые последовательности ординалов»
Доклады АН СССР,
1971, т. 196. No 6, Наука. |
1970 |
| Любецкий В.А., «Существование неизмеримого множества типа A2 влечёт существование несчётного множества без совершенного ядра типа CA»,
Доклады АН СССР,
1970, том 195, № 3, стр. 548–550. |
1969 |
| Любецкий В.А., «Конструкция эффективно недостижимого кардинала в некотором естественном расширении теории множеств Цермело-Френкеля»
Доклады АН СССР,
1969, т. 187, № 6, Наука. |
1968 |
| Любецкий В.А., «Некоторые следствия гипотезы о несчётности множества конструктивных (по Гёделю) вещественных чисел»
Доклады АН СССР,
1968, т. 182, № 4, сс. 758–759, Наука. |