Структура института >> Научные подразделения >> Лаборатория №19
ЛАБОРАТОРИЯ № 19
Геномики растений
Заведующий лабораторией– канд. биол. наук ПЕНИН Алексей Александрович
(Москва, Губкина, д. 3)
Растущая численность населения Земли и нарастание аномальных климатических явлений ставят новые вызовы перед сельским хозяйством по выведению новых сортов как более урожайных, так и более устойчивых к неблагоприятным условиям среды. В последние годы активно развиваются новые методы значительно расширяющие возможности проведения селекционных работ, такие как геномная селекция и направленное редактирование геномов. Одним из основных препятствий их широкого использования служит крайне ограниченная информация о функциях генов у сельскохозяйственных культур. Прежде всего это связано с трудоемкостью и дороговизной проведения большого массива генетических экспериментов, а все основные исследования проводятся на единичных модельных объектах, таких как Arabidopsis thaliana. Попытки прямого перенесения данных о функциях генов модельных объектов на сельскохозяйственные часто оказывается неудачным, как из-за изменения генами своих функций у разных групп растений так и из-за несовершенных алгоритмов. Дополнительно задача усложняется многочисленными циклами полиплоидизации с последующей суб- и нео- функционализацией генов. Недостаточное ускорение селекционной работы, вызванное в том числе недостатком информации о генах конкретных объектов, может привести к недостатку новых сортов в среднесрочной перспективе. Деятельность лаборатории направлена на преодоление некоторых из этих проблем. В том числе, в лаборатории проводится как изучение функций генов на модельных объектах для установления структуры сетей генетической регуляции признаков, так и анализ генов сельскохозяйственных объектов, таких как гречиха, томат, подсолнечник и других. Помимо этого ведется разработка алгоритмов и программного обеспечения для анализа геномных данных, в том числе для улучшения структурной и функциональной аннотации геномов сельскохозяйственных растений.
Основные проекты
- РНФ, проект № 21-74-20145 по теме «Анализ генетических основ экологической пластичности полиплоидных растений».
- Соисполнители в проекте выполняемом в рамках Федеральной научно-технической программы развития генетических технологий на 2019–2027 годы. Проект № 075-15-2021-1064. Исследование потенциала геномного редактирования в контексте современных методов селекции растений, основанных на достижениях функциональной геномики и машинного обучения (головная организация ИОГен РАН).
- Выполнение государственного задания № FFNU-2022-0037 по теме «Анализ геномных и транскриптомных данных для изучения функций и эволюции генов у цветковых растений».
Сотрудники
|
Абдулкина Лилия Ринатовна
|
|
|
Научный сотрудник, кандидат биол. наук |
|
Ежова Маргарита Андреевна
|
|
|
Младший научный сотрудник
|
|
Касьянова Александра Михайловна
|
|
|
Стажер-исследователь |
|
Клепикова Анна Владимировна
|
|
|
Старший научный сотрудник, кандидат биол. наук
|
|
Логачева Мария Дмитриевна
|
|
|
Научный сотрудник, кандидат биол. наук
|
|
Омельченко Денис Олегович
|
|
|
Научный сотрудник, кандидат биол. наук
|
|
Пенин Алексей Александрович
|
|
|
Заведующий лабораторией, к.н. |
|
Щелкунов Михаил Игоревич
|
|
|
Младший научный сотрудник
|
|
Юдина Софья Всеволодовна
|
|
|
Младший научный сотрудник
|
| 
