ВЕРСИЯ ДЛЯ СЛАБОВИДЯЩИХ
Войти
Логин:
Пароль:
Забыли пароль?
научная деятельность
структура институтаобразовательные проектыпериодические изданиясотрудники институтапресс-центрконтакты
русский | english
Научная деятельность >> Семинары >> Открытый семинар лаборатории №6

Открытый семинар Лаборатории №6
"Математические методы и модели в биоинформатике

Семинар посвящён в основном математическим методам и моделям в математической биологии, а в меньшей степени примыкающим проблемам дискретной оптимизации и математической логики.

Семинар проходит один раз в месяц по четвергам с 15.00 по адресу: Москва, Большой Каретный переулок, д.19. стр.1., ИППИ РАН, аудитория 615.

Руководитель В.А. Любецкий.
По вопросам участия просьба обращаться к секретарю семинара - О.А. Зверкову.

 

8 декабря 2022 года, 1500 аудитория 615.

Тема: Статистический анализ связи расстояний между генами и температуры окружающей среды у бактерий, архей и водорослей.

Докладчики: Любецкий Василий АлександровичСеливерстов Александр Владиславович (лаб. 6)

Аннотация: 

Обсуждается вопрос о возможности статистических закономерностей между геномом вида и средой, в которой вид живёт. В эволюции вид после значимого изменения температуры, наиболее для него благоприятной, меняет расстояния между генами. Здесь могут быть и другие факторы среды, как и другие характеристики генома. Расстояние можно понимать как медиану расстояний между соседними генами. Статистический анализ рассмотренных видов (бактерий, архей и водорослей), в частности, приводит к следующим заключениям. Высокая температура и большая медиана не встречаются. Высокая температура часто сочетается с маленькой медианой. Обычно существует значение температуры, при которой виды демонстрируют большое разнообразие медиан.

Мы сосредоточимся на постановке этого вопроса, а в качестве иллюстрации расскажем о регрессионных связях для упомянутых видов.

Температура среды и расстояния между генами существенно влияют на внутриклеточные процессы. Например, они влияют на один из основных процессов – чтение ДНК полимеразой (элонгация РНК-полимеразы): скорость чтения становится выше, а гены становятся ближе друг к  другу.

 


29 сентября 2022 года

 

Открытый семинар лабораторий Математических методов и моделей в биоинформатике и Методы анализа и цифровой обработки изображений.

Тема: Компьютерный поиск генов, потеря/приобретение которых в эволюции может лежать в основе потери/приобретении фенотипического признака

Докладчики: Любецкий Василий Александрович (лаб. №6, ИППИ РАН), Рубанов Лев Израилевич (лаб. №2, ИППИ РАН)

Аннотация: В докладе будет рассказано о недавнем результате авторов (совместно с лабораторией института биоорганической химии им. Шемякина-Овчинникова), представленном в биологический журнал. В докладе будет рассказано об общем методе, который позволяет находить гены, присутствующие в одном множестве видов и отсутствующие в другом множестве видов; сами множества подбираются по присутствию и соответственно отсутствию у них интересующего признака, который выбран заранее.  В работе метод применяется к биологическим признакам (холоднокровность против теплокровности, неразвитый передний мозг против развитого, низкая видовая продолжительность жизни против высокой и т.д.). Задача поиска соответствия явлений на столь далёких уровнях организации материи (в биологии: ген – фенотипический признак) может быть интересной и в других контекстах. 

Семинар открытый, предполагается обсуждение.

НОВОСТИ И ОБЪЯВЛЕНИЯ
В четверг 7 декабря в 14:30 на семинаре Лаборатории № 8 доклад П.А. Чочиа. История исследований в ла...
Московский телекоммуникационный семинар: 1 декабря (пятница), 17:00, онлайн. Екатерина Степанова «Ис...
Семинар сектора репродукции и синтеза цвета: 30 ноября (четверг), 17:00. Павел Максимов «Аномалии цв...
В четверг 30 ноября в 14:30 на семинаре Лаборатории № 8 доклад В.Л. Дунина-Барковского. О механизмах...
Московский телекоммуникационный семинар: 24 ноября (пятница), 17:00, онлайн. Михаил Любогощев "Разра...
Открытый семинар лаборатории зрительных систем: 23 ноября (четверг), 15:00, ауд. 615. Галина Рожкова...
В четверг 23 ноября в 14:30 на семинаре Лаборатории № 8 доклад В.А. Антонца. Ограниченная скорость д...
Московский телекоммуникационный онлайн-семинар: 17 ноября (пятница), 17:00. Андрей Тярин "Архитектур...
В четверг 16 ноября в 14:30 на семинаре Лаборатории № 8 доклады В.Ю. Ведениной, А.В. Лиманской и А.Т...
Cовместный семинар лабораторий зрительных систем и лаборатории цифровой документации русского языка:...
Все новости   
 

 

© Федеральное государственное бюджетное учреждение науки
Институт проблем передачи информации им. А.А. Харкевича Российской академии наук, 2023
Об институте  |  Контакты  |  Противодействие коррупции