Войти
Логин:
Пароль:
Забыли пароль?
научная деятельность
структура институтаобразовательные проектыпериодические изданиясотрудники институтапресс-центрконтакты
русский | english
Научная деятельность >> Семинары >> Открытый семинар лаборатории №6

Открытый семинар Лаборатории №6
"Математические методы и модели в биоинформатике

Семинар посвящён в основном математическим методам и моделям в математической биологии, а в меньшей степени примыкающим проблемам дискретной оптимизации и математической логики.

Семинар проходит один раз в месяц по четвергам с 15.00 по адресу: Москва, Большой Каретный переулок, д.19. стр.1., ИППИ РАН, аудитория 615.

Руководитель В.А. Любецкий.
По вопросам участия просьба обращаться к секретарю семинара - О.А. Зверкову.

 

8 декабря 2022 года, 1500 аудитория 615.

Тема: Статистический анализ связи расстояний между генами и температуры окружающей среды у бактерий, архей и водорослей.

Докладчики: Любецкий Василий АлександровичСеливерстов Александр Владиславович (лаб. 6)

Аннотация: 

Обсуждается вопрос о возможности статистических закономерностей между геномом вида и средой, в которой вид живёт. В эволюции вид после значимого изменения температуры, наиболее для него благоприятной, меняет расстояния между генами. Здесь могут быть и другие факторы среды, как и другие характеристики генома. Расстояние можно понимать как медиану расстояний между соседними генами. Статистический анализ рассмотренных видов (бактерий, архей и водорослей), в частности, приводит к следующим заключениям. Высокая температура и большая медиана не встречаются. Высокая температура часто сочетается с маленькой медианой. Обычно существует значение температуры, при которой виды демонстрируют большое разнообразие медиан.

Мы сосредоточимся на постановке этого вопроса, а в качестве иллюстрации расскажем о регрессионных связях для упомянутых видов.

Температура среды и расстояния между генами существенно влияют на внутриклеточные процессы. Например, они влияют на один из основных процессов – чтение ДНК полимеразой (элонгация РНК-полимеразы): скорость чтения становится выше, а гены становятся ближе друг к  другу.

 


29 сентября 2022 года

 

Открытый семинар лабораторий Математических методов и моделей в биоинформатике и Методы анализа и цифровой обработки изображений.

Тема: Компьютерный поиск генов, потеря/приобретение которых в эволюции может лежать в основе потери/приобретении фенотипического признака

Докладчики: Любецкий Василий Александрович (лаб. №6, ИППИ РАН), Рубанов Лев Израилевич (лаб. №2, ИППИ РАН)

Аннотация: В докладе будет рассказано о недавнем результате авторов (совместно с лабораторией института биоорганической химии им. Шемякина-Овчинникова), представленном в биологический журнал. В докладе будет рассказано об общем методе, который позволяет находить гены, присутствующие в одном множестве видов и отсутствующие в другом множестве видов; сами множества подбираются по присутствию и соответственно отсутствию у них интересующего признака, который выбран заранее.  В работе метод применяется к биологическим признакам (холоднокровность против теплокровности, неразвитый передний мозг против развитого, низкая видовая продолжительность жизни против высокой и т.д.). Задача поиска соответствия явлений на столь далёких уровнях организации материи (в биологии: ген – фенотипический признак) может быть интересной и в других контекстах. 

Семинар открытый, предполагается обсуждение.

НОВОСТИ И ОБЪЯВЛЕНИЯ
В четверг 2 февраля в 14:30 на семинаре Лаборатории обработки сенсорной информации состоится доклад ...
Открытый семинар лаборатории зрительных систем: 2.02.2023 (четверг), 15:00, аудитория 307. Ольга Бас...
В четверг 19 января в 14:30 на семинаре Лаборатории обработки сенсорной информации состоится доклад ...
Открытый семинар лаборатории зрительных систем: 18.01.23 (среда), 15:00, ауд. 307: Галина Рожкова "З...
В пятницу 20 января в 17:00 состоится очередное заседание Московского телекоммуникационного семинара...
В пятницу 13 января 2023 г. в 17:00 состоится очередное заседание Московского телекоммуникационного ...
В четверг 12 января в 14:30 на семинаре Лаборатории обработки сенсорной информации состоится доклад ...
В четверг 22 декабря в 14:30 на семинаре Лаборатории обработки сенсорной информации состоится доклад...
Совместный семинар лаборатории зрительных систем и лаборатории методов анализа и цифровой обработки ...
В четверг 15 декабря в 14:30 на семинаре Лаборатории обработки сенсорной информации состоится доклад...
Все новости   
 

 

  © Федеральное государственное бюджетное учреждение науки
Институт проблем передачи информации им. А.А. Харкевича Российской академии наук, 2023
Об институте  |  Контакты  |  Старая версия сайта