Учебно-научный центр "Биоинформатика" был образован в составе Института проблем передачи информации РАН в конце 2003 года.

Основные направления исследований сотрудников центра – это:

• сравнительная геномика;
• функциональная аннотация генов и белков;
• методы и алгоритмы идентификации регуляторных сигналов;
• метаболическая реконструкция и моделирование;
• метагеномика;
• эволюция метаболических путей и регуляторных систем;
• альтернативный сплайсинг и его эволюция;
• анализ пространственных структур белков, РНК, белок-нуклеиновых комплексов.