Войти
Логин:
Пароль:
Забыли пароль?
научная деятельность
структура институтаобразовательные проектыпериодические изданиясотрудники институтапресс-центрконтакты
русский | english

Создана высокочувствительная программа для работы с огромными базами данных последовательностей ДНК

Младший научный сотрудник учебно-научного центра “Биоинформатика” Института проблем передачи информации им. А.А. Харкевича (ИППИ РАН) Анна Казнадзей приняла участие в создании компьютерной программы NSimScan (Nucleotide Similarity Scanner), позволяющей находить родственные структуры в последовательностях ДНК. Статья с описанием программы опубликована в журнале Bionformatics (Oxford University Press).

Программа NSimScan работает со скоростью самых быстрых аналогов, значительно превосходя их по чувствительности и при многократно сниженной частоте ошибок”. – рассказывает о разработке Анна Казнадзей – “Наилучшие результаты она демонстрирует при поиске структур, совпадающих на 55 - 90 %, в очень больших базах данных. Это делает её удобной для широкомасштабных сравнительных исследований последовательностей ДНК”

Инструмент доступен на https://github.com/abadona/qsimscan и подходит для работы на Linux, OS X и Windows (с cygwin).

Анна Казнадзей на школе-конференции ИТиС-2015

31.03.2016 |
 

 

  © Федеральное государственное бюджетное учреждение науки
Институт проблем передачи информации им. А.А. Харкевича Российской академии наук, 2019
Об институте  |  Контакты  |  Старая версия сайта