Структура института >> Научные подразделения >> УНЦ «Биоинформатика»
Учебно-научный центр «Биоинформатика»
Заведующий центром — Гельфанд Михаил Сергеевич
http://www.rtcb.iitp.ru/
Основные направления исследований сотрудников центра – это:
• сравнительная геномика;
• функциональная аннотация генов и белков;
• методы и алгоритмы идентификации регуляторных мотивов;
• метаболическая реконструкция и моделирование;
• эволюция метаболических путей и регуляторных систем;
• альтернативный сплайсинг и редактирование мРНК и их эволюция;
• пан-геномика, эволюция бактериальных геномов;
• метагеномика;
• анализ пространственных структур белков, РНК, белок-нуклеиновых комплексов;
• системная биология;
• транскриптомика и эпигеномика, анализ пространственной структуры хроматина, анализ РНК-ДНКовых контактах у эукариот.
Среди основных научных результатов Центра:
• оригинальная методика сравнительного анализа регуляторных сигналов в геномах прокариот;
• обнаружение нового типа регуляторных сигналов – РНК-переключателей;
• описание новых ферментов, транспортеров, регуляторов (многие предсказания были затем проверены и подтверждены в экспериментальных работах дружественных лабораторий и независимо);
• описание эволюции регуляторных сетей и семейств факторов транскрипции;
• анализ эволюции бактериальных геномов: увеличение частоты транспозонов и геномных перестроек и уменьшение частоты гомологичной рекомбинации у молодых паразитов; объективное определение вида бактерий на основе анализа пан-геномов и классификация вторичных регулонов на хромиды и плазмиды на основе соотношения размеров с хромосомой;
• описание фазовых вариаций в геномах патогенов;
• обнаружение четверного кодона (обязательного сдвига рамки) в геномах инфузорий;
• обнаружение положительного отбора в сайтах редактирования мРНК у головоногих моллюсков;
• анализ пространственной структуры хроматина, в т.ч. единичных клеток;
• описание воспроизведения эмбриональной транскрипционной программы в куколках насекомых с полным превращением;
• доказательство отсутствия энтеротипов метагеномов человека.
Сотрудники Центра разрабатывают учебные планы, курсы лекций, сборники упражнений по биоинформатике, читают лекции и ведут занятия на факультете биоинженерии и биоинформатики МГК, в программах «Науки о жизни» Сколтеха и «Анализ данных в биологии и медицине» факультета компьютерных наук ВШЭ.
Сотрудники:
| Аванесян Богдан Гамлетович |
Младший научный сотрудник |
| Ашниев Герман Альфредович |
Младший научный сотрудник |
| Быков Николай Сергеевич |
Младший научный сотрудник |
| Виноградов Дмитрий Валерьевич |
Младший научный сотрудник |
| Денисов Степан Владимирович |
Научный сотрудник, кан. биол. наук |
| Еникеева Фарида Наилевна |
Старший научный сотрудник, кан. физ.-мат. наук |
| Журавлева Екатерина Владимировна |
Стажер-исследователь |
| Звездин Дмитрий Сергеевич |
Стажер-исследователь |
| Казнадзей Анна Денисовна |
Старший научный сотрудник, кан. биол. наук |
| Коростелев Юрий Дмитриевич |
Младший научный сотрудник |
| Лёвина Татьяна Борисовна |
Стажер-исследователь |
| Озерова Александра Михайловна |
Младший научный сотрудник |
| Охтиенко Анастасия Сергеевна |
Младший научный сотрудник |
| Ракитин Денис Игоревич |
Младший научный сотрудник |
| Рябых Григорий Кириллович |
Младший научный сотрудник |
| Татаринова Татьяна Валерьевна |
Старший научный сотрудник, кан. биол. наук |
| Школиков Алексей Сергеевич |
Стажер-исследователь |
| Степанова Вита Васильевна |
Стажер-исследователь |
| 
