Структура института >> Научные подразделения >> Сектор № 6
СЕКТОР № 6
Функциональная и сравнительная геномика прокариот
Заведующий сектором - к.б.н. Родионов Дмитрий Александрович
Сектор " Функциональной и сравнительной геномики прокариот" создан с целью проведения исследований в области сравнительной и функциональной геномики прокариотических микроорганизмов.
Основным направлением работы сектора является анализ геномных последовательностей бактерий для реконструкции путей центрального метаболизма и изучения регуляторных транскрипционных сетей у различных микроорганизмов.
В ходе проведения исследований по сравнительному компьютерному анализу регуляции транскрипции в геномах бактерий за последние 10 лет были получены обширные научные результаты, изучены регулятороные системы для нескольких десятков новых транскрипционных факторов и РНК переключателей. Впервые найдены и описаны регулоны контролирующие экспрессию генов из центральных метаболических путей биосинтеза и катаболизма, гомеостаза металлов и ответа на клеточные стрессы. Метаболическая реконструкция многих из этих метаболических путей позволила впервые найти и приписать функцию множеству новых ферментов, транспортеров и регуляторов, были проведено широкомасштабное сравнение систем регуляции некоторых метаболических путей в различных таксономических группах бактерий.
В сотрудничестве с Новичковым П.С. из Национальной Лаборатории Лоуренса Беркли была создана новая база данных RegPrecise позволяющая систематизировать бактериальные регулоны, изученные методами сравнительной геномики, и показывать их структуру и консервативность в группах геномов с использованием концепции регулога. Детальное описание многих изученных регуляторных систем загружено и представлено в базе данных RegPrecise доступной на сайте http://regprecise.lbl.gov.
СОТРУДНИКИ СЕКТОРА:
| 
