Войти
Логин:
Пароль:
Забыли пароль?
научная деятельность
структура институтаобразовательные проектыпериодические изданиясотрудники институтапресс-центрконтакты
русский | english
Публикаций на странице:    Страница: 1
2015 г.
Авторы: Казанов М.Д., Roberts S.A., Polak P., Stamatoyannopoulos J., Klimczak L.J., Gordenin D.A., Sunyaev S.R.

APOBEC-Induced Cancer Mutations Are Uniquely Enriched in Early-Replicating, Gene-Dense, and Active Chromatin Regions, Cell Reports 13(6), pp.1103-1109, 2015.

2015 г.
Авторы: Гарушянц С.К., Казанов М.Д., Гельфанд М.С.

Horizontal gene transfer and genome evolution in Methanosarcina, BMC Evolutionary Biology, 15(1):102,2015.

2015 г.
Авторы: Kumar S., Ratnikov B.I., Казанов М.Д., Smith J.W., Cieplak P.

CleavPredict: a platform for reasoning about matrix metalloproteinases proteolytic events, PLoS One, 10(5):e0127877, 2015.

2015 г.
Авторы: Родионова И.А., Zuccola H.J., Sorci L., Алешин А.Е., Казанов М.Д., Ma C.T., Sergienko E., Rubin E.J., Locher C.P., Osterman A.L.

Mycobacterial Nicotinate Mononucleotide Adenylyltransferase: Structure, Mechanism, and Implications for Drug Discovery, Journal of Biological Chemistry, 290(12), pp. 7693-7706, 2015.

2014 г.
Авторы: Pendlebury D., Wang R., Henin R.D., Hockla A., Soares A.S., Madden B.J., Казанов М.Д., Radisky E.S.

Sequence and Conformational Specificity in Substrate Recognition: Several Human Kunitz Protease Inhibitor Domains are Specific Substrates of Mezotrypsin, Journal of Biological Chemistry, 289(47), pp.32783-32797, 2014.

2014 г.
Авторы: Ratnikov B.I., Cieplak P., Gramatikoff K., Pierce J., Eroshkin A., Igarashi Y., Казанов М.Д., Sun Q, Godzik A., Osterman A., Stec B., Strongin A., Smith J.W.

Basis for substrate recognition and distinction by matrix metalloproteinases, PNAS, 111(40), E4148-4155, 2014.

2014 г.
Авторы: Sorci L., Brunetti L., Cialabrini L., Mazzola F., Казанов М.Д., D'Auria S., Ruggieri S., Raffaeilli N.

Characterization of bacterial NMN deamidase as a Ser/Lys hydrolase expands diversity of serine amidohydrolases, FEBS Letters, 588(6), pp.1016-1023, 2014.

2014 г.
Авторы: Belushkin A.A., Виноградов Д.В., Гельфанд М.С., Osterman A.L., Cieplak P., Казанов М.Д.

Sequence-derived structural features driving proteolytic processing, Proteomics, 14(1), pp. 42-50, 2014.

2014 г.
Авторы: Ponomarev G.V., Arlazarov V.L., Гельфанд М.С., Казанов М.Д.

ANA HEp-2 cells image classification using number, size, shape and localization of targeted cell regions, Pattern Recognition, 47(7), pp. 2360-2366, 2014.

2014 г.
Авторы: Rueda S., Fathima S., Knight C., Yaqub M., Papageorghiou A., Rahmatullah B., Foi A., Maggioni M., Pepe A., Tohka J., Stebbing R.V., McManigle J.E., Ciurte A., Bresson X., Cuadra M.B., Sun C., Ponomarev G.V., Гельфанд М.С., Казанов М.Д., Wang C., Chen H., Hung C., Noble J.A.

Evaluation and Comparison of Current Fetal Ultrasound Image Segmentation Methods for Biometric Measurements: A Grand Challenge, IEEE Transactions on Medical Imaging, 33(4), pp.797-813, 2014.

2013 г.
Авторы: Novichkov P.S., 60, 170, Лейн С.А., Ковалева Г.Ю., Sutormin R.A., Казанов М.Д., Riehl W., Arkin A.P., Dubchak I., Родионов Д.А.

RegPrecise 3.0 -- A resource for genome-scale exploration of transcriptional regulation in bacteria, BMC Genomics, 14(1):745, 2013.

2013 г.
Авторы: Sun E.I., Лейн С.А., Казанов М.Д., Saier M.H., Родионов Д.А., Novichkov P.S.

Comparative genomics of metabolic capacities of regulons controlled by cis-regulatory RNA motifs in bacteria, BMC Genomics, 2013, 14:597.

2013 г.
Авторы: Cialabrini L., Ruggieri S., Kazanov M., Sorci L., Mazzola F., Orsomando G., Osterman A.L., Raffaelli N.

Genomics-guided analysis of NAD recycling yields functional elucidation of COG1058 as a new family of pyrophosphatases, PLoS One. 2013 Jun 12;8(6):e65595.

2013 г.
Авторы: Gordienko E.N., Kazanov M., Gelfand M.

Evolution of pan-genomes of Escherichia coli, Shigella spp., and Salmonella enterica, J Bacteriol. 2013 Jun;195(12):2786-92.

2013 г.
Авторы: Leyn S., Kazanov M., Sernova N.V., Ermakova E., Novichkov P.S., Rodionov D.

Genomic reconstruction of the transcriptional regulatory network in Bacillus subtilis, J Bacteriol. 2013 Jun;195(11):2463-73.

2013 г.
Авторы: 170, Best A.A., Sernova N.V., Kazanov M., Novichkov P.S., Rodionov D.

Genomic reconstruction of transcriptional regulatory networks in lactic acid bacteria, BMC Genomics. 2013 Feb 12;14:94.

2012 г.
Авторы: Kazanov M., Li X., Gelfand M., L. Osterman A., Rodionov D.

Functional diversification of ROK-family transcriptional regulators of sugar catabolism in the Thermotogae phylum. Nucleic Acids Res. 2012 Dec 2.
Перейти к публикации

2012 г.
Авторы: Tsoy O., A. Pyatnitskiy M., Kazanov M., Gelfand M.

Evolution of transcriptional regulation in closely related bacteria. BMC Evol Biol. 2012 Oct 6;12:200.
Перейти к публикации

2012 г.
Авторы: De Ingeniis J., Ratnikov B., D. Richardson A., A. Scott D., Aza-Blanc P., De K., Kazanov M., Pellecchia M., Ronai Z., L. Osterman A., W. Smith J.

Functional specialization in proline biosynthesis of melanoma. PLoS One. 2012;7(9):e45190.
Перейти к публикации

2012 г.
Авторы: De Ingeniis J., Kazanov M., Shatalin K., Gelfand M., L. Osterman A., Sorci L.

Glutamine versus ammonia utilization in the NAD synthetase family
Перейти к публикации

2011 г.
Авторы: Rodionov D., Novichkov P.S., Stavrovskaya E., Rodionova I.A., Li X, Kazanov M., 170, Gerasimova A.V., 60, Kovaleva G., Permina E.A., Laikova O.N., Overbeek R, Romine M.F., Fredrickson J.K., Arkin A.P., Dubchak I, Osterman A.L., Gelfand M.

Comparative genomic reconstruction of transcriptional networks controlling central metabolism in the Shewanella genus. BMC Genomics. 2011 Jun 15;12 Suppl 1:S3.
Перейти к публикации

2011 г.
Авторы: Lazarev V.N., Levitskii S.A., Basovskii Y.I., Chukin M.M., Akopian T.A., Vereshchagin V.V., Kostrjukova E.S., Kovaleva G., Kazanov M., Malko D.B., Vitreschak A., Sernova N.V., Gelfand M., Demina I.A., Serebryakova M.V., Galyamina M.A., Vtyurin N.N., Rogov S.I., Alexeev D.G., Ladygina V.G., Govorun V.M.

Complete genome and proteome of Acholeplasma laidlawii. Journal of Bacteriology 2011 Sep;193(18):4943-4953.
Перейти к публикации

2011 г.
Авторы: Kazanov M., Igarashi Y, Eroshkin A.M., Cieplak P, Ratnikov B, Zhang Y, Li Z, Godzik A, Osterman A.L., Smith J.W.

Structural determinants of limited proteolysis. Journal of Proteome Research 2011 Aug 5;10(8):3642-3651.
Перейти к публикации

2011 г.
Авторы: Vakhrusheva A.A., Kazanov M., Mironov A.A., Bazykin G.

Evolution of prokaryotic genes by shift of stop codons. Journal of Molecular Evolution 2011 Feb;72(2):138-146.
Перейти к публикации

2007 г.
Авторы: Kazanov M., Vitreschak A., Gelfand M.

Abundance and functional diversity of riboswitches in microbial communities. BMC Genomics. 2007 Oct 1;8:347.
Перейти к публикации

2007 г.
Авторы: Ермакова Е.О.

Ermakova EO, Nurtdinov RN, Gelfand MS. Overlapping alternative donor splice sites in the human genome. J Bioinform Comput Biol. 5(5):991-1004, 2007.
Загрузить (405.7 KB)

2007 г.
Авторы: 60, J. Cipriano M., С. Новичков П., Minovitsky S., Виноградов Д.В., Arkin A., А. Миронов А., Л. Дубчак И., Гельфанд М.С.

"RegTransBase - a database of regulatory sequences and interactions in a wide range of prokaryotic genomes." Nucleic Acids Res., 2007, 35:D407-12.
Перейти к публикации

2006 г.
Авторы: Ермакова Е.О.

Нуртдинов Р.Н., Неверов А.Д., Малько Д.Б., Космодемьянский И.А., Ермакова Е.О., Раменский В.Е., Миронов А.А., Гельфанд М.С. EDAS - база данных альтернативно сплайсированных генов человека. Биофизика 51(4): 589-592, 2006
Загрузить (53.4 KB)

2006 г.
Авторы: Ермакова Е.О.

Ермакова Е.О., Малько Д.Б., Гельфанд М.С. Эволюционные отличия альтернативных и постоянных белок-кодирующих участков альтернативно сплайсируемых генов Drosophila. Биофизика 51(4): 581-588, 2006
Загрузить (156 KB)

2006 г.
Авторы: Ермакова Е.О.

Ermakova EO, Nurtdinov RN, Gelfand MS. Fast rate of evolution in alternatively spliced coding regions of mammalian genes. BMC Genomics 7:84, 2006.
Перейти к публикации Загрузить (501.8 KB)

2006 г.
Авторы: Kovaleva G., Bazykin G., Brudno M., Gelfand M.

Comparative genomics of transcriptional regulation in yeasts and its application to identification of a candidate alpha-isopropylmalate transporter. Journal of Bioinformatics and Computational Biology 4(5):981–998.
Загрузить (1 MB)

2003 г.
Авторы: Виноградов Д.В.

ProMult: prediction of the exon-introns tructure by spliced alignment with several proteins. Биофизика (Москва). 2003, том 48 тематический выпуск 1, стр.68-70
Перейти к публикации Загрузить (702.2 KB)

Публикаций на странице:    Страница: 1
Поиск по публикациям
Год публикации
с по
Автор

Название/ключевое слово

Тип публикации

Наличие в международных базах цитирования
Искать в подразделении

По убыванию даты
По возрастанию даты
 

 

  © Федеральное государственное бюджетное учреждение науки
Институт проблем передачи информации им. А.А. Харкевича Российской академии наук, 2019
Об институте  |  Контакты  |  Старая версия сайта