Войти
Логин:
Пароль:
Забыли пароль?
научная деятельность
структура институтаобразовательные проектыпериодические изданиясотрудники институтапресс-центрконтакты
русский | english
Публикаций на странице:    Страница: 1 2
2015 г.
Авторы: Казанов М.Д., Roberts S.A., Polak P., Stamatoyannopoulos J., Klimczak L.J., Gordenin D.A., Sunyaev S.R.

APOBEC-Induced Cancer Mutations Are Uniquely Enriched in Early-Replicating, Gene-Dense, and Active Chromatin Regions, Cell Reports 13(6), pp.1103-1109, 2015.

2015 г.
Авторы: Гарушянц С.К., Казанов М.Д., Гельфанд М.С.

Horizontal gene transfer and genome evolution in Methanosarcina, BMC Evolutionary Biology, 15(1):102,2015.

2015 г.
Авторы: Kumar S., Ratnikov B.I., Казанов М.Д., Smith J.W., Cieplak P.

CleavPredict: a platform for reasoning about matrix metalloproteinases proteolytic events, PLoS One, 10(5):e0127877, 2015.

2015 г.
Авторы: Родионова И.А., Zuccola H.J., Sorci L., Алешин А.Е., Казанов М.Д., Ma C.T., Sergienko E., Rubin E.J., Locher C.P., Osterman A.L.

Mycobacterial Nicotinate Mononucleotide Adenylyltransferase: Structure, Mechanism, and Implications for Drug Discovery, Journal of Biological Chemistry, 290(12), pp. 7693-7706, 2015.

2014 г.
Авторы: Pendlebury D., Wang R., Henin R.D., Hockla A., Soares A.S., Madden B.J., Казанов М.Д., Radisky E.S.

Sequence and Conformational Specificity in Substrate Recognition: Several Human Kunitz Protease Inhibitor Domains are Specific Substrates of Mezotrypsin, Journal of Biological Chemistry, 289(47), pp.32783-32797, 2014.

2014 г.
Авторы: Ratnikov B.I., Cieplak P., Gramatikoff K., Pierce J., Eroshkin A., Igarashi Y., Казанов М.Д., Sun Q, Godzik A., Osterman A., Stec B., Strongin A., Smith J.W.

Basis for substrate recognition and distinction by matrix metalloproteinases, PNAS, 111(40), E4148-4155, 2014.

2014 г.
Авторы: Sorci L., Brunetti L., Cialabrini L., Mazzola F., Казанов М.Д., D'Auria S., Ruggieri S., Raffaeilli N.

Characterization of bacterial NMN deamidase as a Ser/Lys hydrolase expands diversity of serine amidohydrolases, FEBS Letters, 588(6), pp.1016-1023, 2014.

2014 г.
Авторы: Belushkin A.A., Виноградов Д.В., Гельфанд М.С., Osterman A.L., Cieplak P., Казанов М.Д.

Sequence-derived structural features driving proteolytic processing, Proteomics, 14(1), pp. 42-50, 2014.

2014 г.
Авторы: Ponomarev G.V., Arlazarov V.L., Гельфанд М.С., Казанов М.Д.

ANA HEp-2 cells image classification using number, size, shape and localization of targeted cell regions, Pattern Recognition, 47(7), pp. 2360-2366, 2014.

2014 г.
Авторы: Rueda S., Fathima S., Knight C., Yaqub M., Papageorghiou A., Rahmatullah B., Foi A., Maggioni M., Pepe A., Tohka J., Stebbing R.V., McManigle J.E., Ciurte A., Bresson X., Cuadra M.B., Sun C., Ponomarev G.V., Гельфанд М.С., Казанов М.Д., Wang C., Chen H., Hung C., Noble J.A.

Evaluation and Comparison of Current Fetal Ultrasound Image Segmentation Methods for Biometric Measurements: A Grand Challenge, IEEE Transactions on Medical Imaging, 33(4), pp.797-813, 2014.

2013 г.
Авторы: Novichkov P.S., 60, 170, Лейн С.А., Ковалева Г.Ю., Sutormin R.A., Казанов М.Д., Riehl W., Arkin A.P., Dubchak I., Родионов Д.А.

RegPrecise 3.0 -- A resource for genome-scale exploration of transcriptional regulation in bacteria, BMC Genomics, 14(1):745, 2013.

2013 г.
Авторы: Sun E.I., Лейн С.А., Казанов М.Д., Saier M.H., Родионов Д.А., Novichkov P.S.

Comparative genomics of metabolic capacities of regulons controlled by cis-regulatory RNA motifs in bacteria, BMC Genomics, 2013, 14:597.

2013 г.
Авторы: Cialabrini L., Ruggieri S., Kazanov M., Sorci L., Mazzola F., Orsomando G., Osterman A.L., Raffaelli N.

Genomics-guided analysis of NAD recycling yields functional elucidation of COG1058 as a new family of pyrophosphatases, PLoS One. 2013 Jun 12;8(6):e65595.

2013 г.
Авторы: Gordienko E.N., Kazanov M., Gelfand M.

Evolution of pan-genomes of Escherichia coli, Shigella spp., and Salmonella enterica, J Bacteriol. 2013 Jun;195(12):2786-92.

2013 г.
Авторы: Leyn S., Kazanov M., Sernova N.V., Ermakova E., Novichkov P.S., Rodionov D.

Genomic reconstruction of the transcriptional regulatory network in Bacillus subtilis, J Bacteriol. 2013 Jun;195(11):2463-73.

2013 г.
Авторы: 170, Best A.A., Sernova N.V., Kazanov M., Novichkov P.S., Rodionov D.

Genomic reconstruction of transcriptional regulatory networks in lactic acid bacteria, BMC Genomics. 2013 Feb 12;14:94.

2012 г.
Авторы: Kazanov M., Li X., Gelfand M., L. Osterman A., Rodionov D.

Functional diversification of ROK-family transcriptional regulators of sugar catabolism in the Thermotogae phylum. Nucleic Acids Res. 2012 Dec 2.
Перейти к публикации

2012 г.
Авторы: Tsoy O., A. Pyatnitskiy M., Kazanov M., Gelfand M.

Evolution of transcriptional regulation in closely related bacteria. BMC Evol Biol. 2012 Oct 6;12:200.
Перейти к публикации

2012 г.
Авторы: De Ingeniis J., Ratnikov B., D. Richardson A., A. Scott D., Aza-Blanc P., De K., Kazanov M., Pellecchia M., Ronai Z., L. Osterman A., W. Smith J.

Functional specialization in proline biosynthesis of melanoma. PLoS One. 2012;7(9):e45190.
Перейти к публикации

2012 г.
Авторы: De Ingeniis J., Kazanov M., Shatalin K., Gelfand M., L. Osterman A., Sorci L.

Glutamine versus ammonia utilization in the NAD synthetase family
Перейти к публикации

2011 г.
Авторы: Rodionov D., Novichkov P.S., Stavrovskaya E., Rodionova I.A., Li X, Kazanov M., 170, Gerasimova A.V., 60, Kovaleva G., Permina E.A., Laikova O.N., Overbeek R, Romine M.F., Fredrickson J.K., Arkin A.P., Dubchak I, Osterman A.L., Gelfand M.

Comparative genomic reconstruction of transcriptional networks controlling central metabolism in the Shewanella genus. BMC Genomics. 2011 Jun 15;12 Suppl 1:S3.
Перейти к публикации

2011 г.
Авторы: Lazarev V.N., Levitskii S.A., Basovskii Y.I., Chukin M.M., Akopian T.A., Vereshchagin V.V., Kostrjukova E.S., Kovaleva G., Kazanov M., Malko D.B., Vitreschak A., Sernova N.V., Gelfand M., Demina I.A., Serebryakova M.V., Galyamina M.A., Vtyurin N.N., Rogov S.I., Alexeev D.G., Ladygina V.G., Govorun V.M.

Complete genome and proteome of Acholeplasma laidlawii. Journal of Bacteriology 2011 Sep;193(18):4943-4953.
Перейти к публикации

2011 г.
Авторы: Kazanov M., Igarashi Y, Eroshkin A.M., Cieplak P, Ratnikov B, Zhang Y, Li Z, Godzik A, Osterman A.L., Smith J.W.

Structural determinants of limited proteolysis. Journal of Proteome Research 2011 Aug 5;10(8):3642-3651.
Перейти к публикации

2011 г.
Авторы: Vakhrusheva A.A., Kazanov M., Mironov A.A., Bazykin G.

Evolution of prokaryotic genes by shift of stop codons. Journal of Molecular Evolution 2011 Feb;72(2):138-146.
Перейти к публикации

2010 г.
Авторы: Новичков П.С., Лайкова О.Н., Новичкова Е.С., Гельфанд М.С., Аркин А.П., Дубчак И., Родионов Д.А.

RegPrecise: a database of curated genomic inferences of transcriptional regulatory interactions in prokaryotes. Nucleic Acids Res, 38: D111-D118.
Перейти к публикации Загрузить (474.3 KB)

2010 г.
Авторы: Gorbunov K., Laikova O.N., Rodionov D., Gelfand M., Lyubetsky V.

“Evolution of regulatory motifs of bacterial transcription factors” In Silico Biology, 2010, 10, 0012.
Перейти к публикации Загрузить (381.9 KB)

2009 г.
Авторы: Zhang Y., Родионов Д.А., Гельфанд М.С., Гладышев В.Н.

Comparative genomic analyses of nickel, cobalt and vitamin B12 utilization. BMC Genomics, 2009, 10: 78.
Перейти к публикации

2009 г.
Авторы: Raker V., Mironov A., Gelfand M., Pervouchine D.

Modulation of alternative splicing by long-range RNA structures in Drosophila. Nucleic Acids Res. 2009, 37(14):4533-44 .
Перейти к публикации

2009 г.
Авторы: Desai T.A., Родионов Д.А., Гельфанд М.С., Alm E.J., Rao C.V.

Desai TA, Rodionov DA, Gelfand MS, Alm EJ, Rao CV. (2009) Engineering transcription factors with novel DNA-binding specificity using comparative genomics. Nucleic Acids Res, 37: 2493-503.
Перейти к публикации Загрузить (2.6 MB)

2009 г.
Авторы: Gelfand M., 60, Korostelev Y., Laikova O., Mironov A., Rakhmaninova A., 170, Rodionov D., Vitreschak A.

Evolution of Regulatory Systems in Bacteria. Lecture Notes in Bioinformatics. 2009; 5542 (ISBRA 2009): 1-4.

2009 г.
Авторы: Nurtdinov R., Mironov A., Gelfand M.

Rodent-specific alternative exons are more frequent in rapidly evolving genes and in paralogs. BMC Evol Biol. 2009, 9: 142.
Перейти к публикации

2009 г.
Авторы: Huang N., De Ingeniis J., Galeazzi L., Mancini C., Korostelev Y.D., Rakhmaninova A., Gelfand M., Rodionov D., Raffaelli N., Zhang H.

Structure and function of an ADP-ribose-dependent transcriptional regulator of NAD metabolism. Structure. 2009, 17: 939-51.
Перейти к публикации Загрузить (2.1 MB)

2009 г.
Авторы: Kalinina O., Gelfand M., Russell R.

Combining specificity determining and conserved residues improves functional site prediction. BMC Bioinformatics. 2009, 10: 174.

2009 г.
Авторы: Гельфанд М.С.

Геномы и эволюция. Вестник РАН, 2009, 79(5) 411-418.
Перейти к публикации

2009 г.
Авторы: Ракитин Д.И., Гельфанд М.С.

Совместная метаболическая активность тли Acyrthosiphon pisum и симбиотической бактерии Buchnera aphidicola STR APS Молекулярная биология. 2009, 43(6): 1093-95 PDF
Перейти к публикации

2008 г.
Авторы: Kurmangaliyev Y., Gelfand M.

Computational analysis of splicing errors and mutations in human transcripts. BMC Genomics. 2008, 9(1): 13.
Перейти к публикации

2008 г.
Авторы: Vitreschak A., Mironov A., Lyubetsky V., Gelfand M.

“Comparative genomic analysis of T-box regulatory systems in bacteria” Ribonucleic acids molecular biology (RNA), V. 14, No. 4, April 2008, pp. 717-735. PMID: 18359782
Перейти к публикации

2007 г.
Авторы: Kazanov M., Vitreschak A., Gelfand M.

Abundance and functional diversity of riboswitches in microbial communities. BMC Genomics. 2007 Oct 1;8:347.
Перейти к публикации

2007 г.
Авторы: Витрещак А.Г., Миронов А.А., Любецкий В.А., Гельфанд М.С.

«Компьютерный анализ, функциональная аннотация и изучение эволюции Т-бокс регулона в бактериях» Труды конференции ИТиС 30, Звенигород, 18–21 сентября 2007, сс. 220-221.

2007 г.
Авторы: Vitreschak A., Lyubetsky V., Gelfand M.

“Analysis of evolution of T-box regulatory elements prediction of amino acid transporters and other amino acid related genes” Proceedings of the international scientific conference “Computational Phylogenetics and Molecular Systematics, CPMS’2007”, November 16–19 2007, KMK Scientific Press, Moscow, pp. 30–37.

2007 г.
Авторы: Vitreschak A., Mironov A., Lyubetsky V., Gelfand M.

“Function and evolutionary analysis of the T-box regulon in bacteria” Proceedings of International Moscow Conference on Computational Molecular Biology: МССМВ’07, November 2007, pp. 309–310.

2007 г.
Авторы: Gorbunov K., Radionov D., Laikova O., Gelfand M., Lyubetsky V.

“Reconstruction of ancestral regulatory signal along a phylogeny” Proceedings of International Moscow Conference on Computational Molecular Biology: МССМВ’07, 2007, pp. 111–113.

2007 г.
Авторы: Ермакова Е.О.

Ermakova EO, Nurtdinov RN, Gelfand MS. Overlapping alternative donor splice sites in the human genome. J Bioinform Comput Biol. 5(5):991-1004, 2007.
Загрузить (405.7 KB)

2007 г.
Авторы: Северинов К., Семенова Е., 60, Казаков Т., Гельфанд М.С.

"Low-molecular-weight post-translationally modified microcins." Mol Microbiol., 2007, 65(6):1380-94.
Перейти к публикации

2007 г.
Авторы: 60, J. Cipriano M., С. Новичков П., Minovitsky S., Виноградов Д.В., Arkin A., А. Миронов А., Л. Дубчак И., Гельфанд М.С.

"RegTransBase - a database of regulatory sequences and interactions in a wide range of prokaryotic genomes." Nucleic Acids Res., 2007, 35:D407-12.
Перейти к публикации

2006 г.
Авторы: Садовская Н.С., Гельфанд М.С., Р.А. Сутормин

Recognition of transmembrane segments in proteins: review and consistency-based benchmarking of internet servers. J. Bioinformatics and Computational Biology. 2006, 4(5): 1033-56.
Загрузить (308.6 KB)

2006 г.
Авторы: Vitreschak A., Lyubetsky V., Gelfand M.

“Evolutional and Functional Analysis of T-box Regulon in Bacteria: Identification of new Genes Involved in Amino Acid Metabolism” Proceedings of The Fifth International Conference on Bioinformatics of Genome Regulation and Structure (BGRS’2006), Novosibirsk, July 16–22 2006, V. 3, pp. 236–240.
Перейти к публикации

2006 г.
Авторы: А. Пермина Е., 60, В. Калинина О., Гельфанд М.С.

"Comparative genomics of regulation of heavy metal resistance in Eubacteria." BMC Microbiol., 2006, 6:49.
Перейти к публикации

2006 г.
Авторы: Ермакова Е.О.

Нуртдинов Р.Н., Неверов А.Д., Малько Д.Б., Космодемьянский И.А., Ермакова Е.О., Раменский В.Е., Миронов А.А., Гельфанд М.С. EDAS - база данных альтернативно сплайсированных генов человека. Биофизика 51(4): 589-592, 2006
Загрузить (53.4 KB)

2006 г.
Авторы: Ермакова Е.О.

Ермакова Е.О., Малько Д.Б., Гельфанд М.С. Эволюционные отличия альтернативных и постоянных белок-кодирующих участков альтернативно сплайсируемых генов Drosophila. Биофизика 51(4): 581-588, 2006
Загрузить (156 KB)

Публикаций на странице:    Страница: 1 2
Поиск по публикациям
Год публикации
с по
Автор

Название/ключевое слово

Тип публикации

Наличие в международных базах цитирования
Искать в подразделении

По убыванию даты
По возрастанию даты
 

 

  © Федеральное государственное бюджетное учреждение науки
Институт проблем передачи информации им. А.А. Харкевича Российской академии наук, 2021
Об институте  |  Контакты  |  Старая версия сайта