“Inferring optimal scenario of gene evolution along a species tree” Abstracts of The Sixth International Conference on Bioinformatics of Genome Regulation and Structure (BGRS’2008), Novosibirsk, June 22–28, p. 90.
Перейти к публикации

«Оценка числа элементов покрытия произвольного теста на случайность частотными тестами» Проблемы передачи информации, 2007, том 43, вып. 1, сс. 65–75.

«Модель эволюции нуклеотидной последовательности» Труды конференции «Математические методы распознавания образов», 2007, сс. 605–609.

“Models of gene expression regulation and evolution of regulatory elements” Proceedings of the international scientific conference “Computational Phylogenetics and Molecular Systematics, CPMS’2007”, November 16–19 2007, KMK Scientific Press, Moscow, pp. 158–165.

“Modeling evolution of the nucleotide sequence with secondary structure” Proceedings of the international scientific conference “Computational Phylogenetics and Molecular Systematics, CPMS’2007”, November 16–19 2007, KMK Scientific Press, Moscow, pp. 68–75.

“Reconstruction of ancestral regulatory signal along a phylogeny” Proceedings of International Moscow Conference on Computational Molecular Biology: МССМВ’07, 2007, pp. 111–113.

«Реконструкция предковых регуляторных сигналов вдоль дерева эволюции фактора транскрипции» Молекулярная биология, 2007, том 41, № 5, стр. 918–925.

“Inferring regulatiory signal profiles and evolutionary events” Proceedings of the Fifth International Conference on Bioinformatics of Genome Regulation and Structure (BGRS"2006), Novosibirsk, Russia, July 16–22 2006, Vol. 3, P. 151–154.
Перейти к публикации

“Algorithms to reconstruct evolutionary events at molecular level and infer species phylogeny” An article in the book: “Bioinformatics of Genome Regulation and Structure II”, Springer Science & Business Media, Inc. 2006, pp. 189–204.
Перейти к публикации

«Макро- и микросостояния в модели аттенюаторной регуляции экспрессии генов у бактерий» Труды конференции РАН «Проблемы управления и моделирования в сложных системах, VII Международная конференция», 2005, Самара, сс. 210–215.

“Algorithms to reconstruct ancestral gene evolution events” MCCMB’05, 2005, pp. 128–129.

«Удаление шума в множественном выравнивании белковых последовательностей» Информационные процессы, 2005, т. 5, № 5, сс. 380–391.
Перейти к публикации

«Алгоритм и результаты счета для модели регуляции экспрессии генов у бактерий на основе формирования вторичных структур РНК» Информационные процессы, 2005, т. 5, № 5, сс. 337–366.
Перейти к публикации

«Поиск предковых генов, нарушающих согласованность деревьев белков и видов» Молекулярная биология, 2005, т. 39, № 5, сс. 847–858. PMID: 16240718

“Inferring evolutionary events, quality of COGs, measuring the dissimilarity between gene and species trees” Presentation abstracts of the EMBO World Phylogenetic Course 2004. November 1–7 2004, Rio de Janeiro, Brazil.

“New approach for detecting common secondary structures in a set of RNA sequences” Biophysics (Moscow), 2004, V. 48, Suppl. 1 (2003), pp. 56–67.

«Модель регуляции биосинтеза» Труды 6-й международной конференции «Проблемы управления и моделирования в сложных системах», 14–17 июня 2004, РАН, сс. 151–153.

“A Model of Tryptophan Biosynthesis Regulation” Proceedings of the Fourth International Conference on Bionnformatics of Genome Regulation and Structure (BGRS’2004), Novosibirsk, July 25–30 2004, V. 2, pp. 53–55.
Перейти к публикации

“Detecting common secondary structures in a set of RNA sequences and its testing” MCCMB’03, 2003, pp. 83–85.

«Поиск консервативной вторичной структуры РНК» Молекулярная биология, том 37, № 5, 2003, сс. 850–860. PMID 14593922

«Поиск консервативных вторичных структур РНК» Информационные процессы, том 3, № 1, 2003, сс. 47–60.

“An Algorithm for Searching for Common Secondary Structures in a Set of RNA Sequences” Proceedings of The Third International Conference on Bioinformatics of Genome Regulation and Structure (BGRS’2002), Novosibirsk, Russia, July 14–20, 2002, V. 3, pp. 20–22.
Перейти к публикации

«Алгоритм поиска консервативных вторичных структур в наборе фрагментов РНК» Информационные процессы, 2002, том 2, № 1, сс. 55–58.

«О двух алгоритмах поиска альтернативной вторичной структуры РНК» Информационные процессы, том 1, № 2, 2001, сс. 178–187.

«Алгоритм выделения регуляторных сигналов в последовательностях ДНК» Молекулярная биология, том 35, № 6, 2001, сс. 987–995. PMID 11771146

«Алгоритм выделения регуляторных сигналов в последовательностях ДНК» Информационные процессы, том 1, № 1, 2001, сс. 56–63.

«Об алгоритме выявления регуляторного сигнала в наборе последовательностей» Логические исследования, выпуск 7, Москва, Наука, 2000, сс. 159–163.

«Алгоритмы выделения регуляторного сигнала и построения эволюционных деревьев» Труды 2-ой международной конференции «Проблемы управления и моделирования в сложных системах», Самара, Издательство РАН, 2000, сс. 130–137.