Выравнивание скрытого палиндрома. Математическая биология и биоинформатика. 2024. Т. 19. N 2. С. 427-438. DOI: 10.17537/2024.19.427
Перейти к публикации
О системах нескольких уравнений по модулю три. XIV Белорусская математическая конференция, посвященная 65-летию Института математики НАН Беларуси: материалы Международной научной конференции. Минск, 28 октября – 1 ноября 2024 г. Минск: Беларуская навука, 2024. Часть 3. С. 152-154. Перейти к публикацииЗагрузить (83.3 KB)
2024 г.
Авторы: Wijayawardene N., Hyde K., Mikhailov K., Peter G., Aptroot A., Pires-Zottarelli C., Goto B., Tokarev Y., Haelewaters D., Karunarathna S., Kirk P., de Santiago A., Saxena R., Schoutteten N., Wimalasena M., Aleoshin V., . . ., Zverkóv O., Thines M., Karpov S.A.
Classes and phyla of the kingdom Fungi.
Fungal Diversity, Sep 2024, Vol. 128, P. 1–165.
DOI: 10.1007/s13225-024-00540-z Перейти к публикации
The change rate of the Fbxl21 gene and the amino acid composition of its protein correlate with the species-specific lifespan in placental mammals.
Biology, 2024, Vol. 13, No. 10, Art. 792.
DOI: 10.3390/biology13100792
(WoS Q1) Перейти к публикации
Нижние границы для ранга матрицы с нулями и единицами вне главной диагонали.
Программирование, 2024, том 50, № 2, стр. 100–107.
DOI: 10.31857/S0132347424020133 Перейти к публикации
Demographic indicators, models, and testing. Discrete and Continuous Models and Applied Computational Science. 2023. V. 31. No. 4. P. 359–374. Перейти к публикации
Связь видовой продолжительности жизни с эволюцией гена Fbxl21.
Proceedings of 11th Moscow Conference on Computational Molecular Biology MCCMB’23.
Москва, 3–6 августа 2023, М.: ИППИ РАН, 2023
Эффективные нижние границы для ранга матрицы и приложения. Программирование. 2023. № 5. С. 79-86.
Перейти к публикации
2023 г.
Авторы: Lyubetsky V., Rubanov L., Tereshina M., Ivanova A., Araslanova K., Uroshlev L., Goremykina G., Yang J., Kanovei V., Zverkóv O., Shitikov A., Korotkova D., Zaraisky A.
Wide-scale identification of novel/eliminated genes responsible for evolutionary transformations.
Biology Direct, 2023, Vol. 18, Art. 45.
DOI: 10.1186/s13062-023-00405-6
(WoS Q1) Перейти к публикации
Evolution of protein regulators of circadian rhythm in mammals.
Bioinformatics of Genome Regulation and Structure/Systems Biology (BGRS/SB-2022), The Thirteenth International Multiconference Abstracts, Novosibirsk, Russia, 4-8 July 2022, Novosibirsk: ICG SB RAS, 2022, P. 173. Перейти к публикации
Complex evolution of Fbxl21 gene in mammals.
Proceedings of the International Moscow Conference on Computational Molecular Biology: MCCMB’21,
Moscow, Russia, July 30 — August 2 2021.
Предсказание потерь генов на основе геномных структур.
Материалы международного форума «Биотехнология: состояние и перспективы развития»,
Москва, 28–30 октября 2020, вып. 18, стр. 258–259.
DOI: 10.37747/2312-640X-2020-18-258-260 Перейти к публикации
New bioinformatics methods for identification of lost genes and protein isoforms.
Homo sapiens liberatus, Proceedings of the 3rd International Conference in celebration of the 85th birthday of professor V.P. Skulachev, Moscow, Russia, February 20–21 2020, Abstract Book.
Moscow: Torus Press, 2020, P. 41–42.
DOI: 10.30826/HomoSapiens-2020-30 Перейти к публикации
Evolution of proteins involved in response to ROS.
Bioinformatics of Genome Regulation and Structure/Systems Biology (BGRS/SB-2020), The Twelfth International Multiconference Abstracts, Novosibirsk, Russia, 6–10 July 2020.
Novosibirsk: ICG SB RAS, 2020, P. 652–653.
DOI: 10.18699/BGRS/SB-2020-398 Перейти к публикацииЗагрузить (844.5 KB)
Protein-coding genes in Euarchontoglires with pseudogene homologs in humans.
Life, 2020, Vol. 10, No. 9, Art. 192.
DOI: 10.3390/life10090192, PMID: 32927891 Перейти к публикации
Optimal growth temperature and intergenic distances in bacteria, archaea, and plastids of rhodophytic branch.
BioMed Research International, 2020, Vol. 2020, Art. 3465380.
DOI: 10.1155/2020/3465380, PMID: 32025518 Перейти к публикации
Dicyemida and Orthonectida: Two stories of body plan simplification.
Proceedings of the International Moscow Conference on Computational Molecular Biology: MCCMB’19,
Moscow, Russia, July 27–30 2019. Перейти к публикации
Гены мыши, потерянные у грызунов и приматов с высокой продолжительностью жизни.
Материалы международного конгресса «Биотехнология: состояние и перспективы развития»,
Москва, 25–27 февраля 2019, вып. 17, стр. 341. Перейти к публикации
Screening for mouse genes lost in mammals with long lifespans.
BioData Mining, 2019, Vol. 12, Art. 20.
DOI: 10.1186/s13040-019-0208-x, PMID: 31728160
(WoS Q1, IF 4) Перейти к публикацииЗагрузить (1.4 MB)
New C-terminal conserved regions of tafazzin, a catalyst of cardiolipin remodeling.
Oxidative Medicine and Cellular Longevity,
Vol. 2019, Art. 2901057.
DOI: 10.1155/2019/2901057, PMID: 31781330 Перейти к публикацииЗагрузить (2.6 MB)
Bioinformatics screening of genes specific for well-regenerating vertebrates reveals c-answer, a regulator of brain development and regeneration.
Cell Reports, Vol. 29, Iss. 4, P. 1027–1040.
DOI: 10.1016/j.celrep.2019.09.038, PMID: 31644900
(WoS Q1, IF 10) Перейти к публикацииЗагрузить (6.1 MB)
Protein clustering and gene loss prediction.
Computer Assisted Mathematics Conference.
Electrotechnical University "LETI" Saint-Petersburg, Russia, July 22-24, 2019. P. 7 Перейти к публикацииЗагрузить (205.8 KB)
Dicyemida and Orthonectida: Two stories of body plan simplification.
Frontiers in Genetics
Vol. 10, Article 443.
DOI: 10.3389/fgene.2019.00443, PMID: 31178892
(WoS Q1, IF 5) Перейти к публикацииЗагрузить (6.2 MB)
Кольцевые последовательности ДНК в геноме Dicyema sp.
ИТИС 2018, Сборник трудов 42-й междисциплинарной школы-конференции ИППИ РАН «Информационные технологии и системы 2018», Казань, 25–30 сентября 2018,
М.: ИППИ РАН, 2018, стр. 584–587. Перейти к публикации
Bioinformatic screening of genes present only in well regenerating vertebrates reveals novel FGF and purinergic signaling modulator - c-Answer.
bioRxiv, 13 Dec 2018.
DOI: 10.1101/494609 Перейти к публикации
Филогения Mesozoa.
Зоология беспозвоночных – новый век,
Материалы конференции, посвященной 160-летию Кафедры зоологии беспозвоночных Биологического факультета МГУ им. М.В. Ломоносова, Москва, 19–21 декабря 2018, стр. 15. Перейти к публикации
Orthonectida and Dicyemida: Two stories of body plan simplification.
In: Molecular Phylogenetics (Eds.: A. Troitsky, L. Rusin),
Moscow: Torus Press, 2018, P. 3–4.
DOI: 10.30826/MolPhy2018-01 Перейти к публикации
Longevity in mammals: lost genes as a determinant.
Bioinformatics of Genome Regulation and Structure\Systems Biology (BGRS\SB-2018): The Eleventh International Conference (20–25 Aug. 2018, Novosibirsk, Russia); Abstracts.
Institute of Cytology and Genetics, Siberian Branch of Russian Academy of Sciences; Novosibirsk State University. –
Novosibirsk: ICG SB RAS, 2018. P. 249.
DOI: 10.18699/BGRSSB-2018-221 Перейти к публикацииЗагрузить (2.2 MB)
Longevity in euarchontoglires: lost genes as a determinant.
FEBS Open Bio,
2018, Vol. 8 (Suppl. 1), P. 456–457;
DOI: 10.1002/2211-5463.12453. Перейти к публикации
Phylogenomic evidence disentangles affinities of the Mesozoa.
Proceedings of the 4th International Congress on Invertebrate Morphology (ICIM4),
Moscow, Russia, August 18–23 2017, P. 55. Перейти к публикации
Evolution and systematics of plastids of rhodophytic branch.
Proceedings of the International Moscow Conference on Computational Molecular Biology: MCCMB’17,
Moscow, Russia, July 27–30 2017, P. 48. Перейти к публикации
Высококонсервативные элементы в митохондриях инфузорий и однодольных растений.
Материалы IX Международного Конгресса «Биотехнология: состояние и перспективы развития»,
Москва, 20–22 февраля 2017, часть 1, стр. 392. Перейти к публикации
Finding long highly conserved elements in complete animal genomes.
CEUR Workshop Proceedings,
Feb 23 2018, Vol. 2064, Convergent Cognitive Information Technologies 2017, P. 402–408, in Russian. Перейти к публикации
Novel transmembrane protein c-Answer revealed by bioinformatic screening of genes present only in well regenerating animals.
FEBS Journal, 2017, Vol. 284, Iss. S1, P. 155.
doi:10.1111/febs.14174
Highly Conserved Elements and Chromosome Structure Evolution in Mitochondrial Genomes in Ciliates.
Life, 2017, Vol. 7, No. 9.
doi:10.3390/life7010009, PMID: 28264444 Перейти к публикации
Problem of phylogenetic position of dicyemids.
Abstracts of the International Symposium "Cognitive Sciences, Genomics and Bioinformatics" (CSGB-2016),
Novosibirsk, Russia, August 29–31 2016, P. 68. Перейти к публикации
Degenerate inverted repeats in the genomes of mycobacterium.
CEUR Workshop Proceedings (CEUR-WS.org), Selected Papers of the First International Scientific Conference Convergent Cognitive Information Technologies (Convergent 2016), Moscow, Russia, November 25–26 2016, vol. 1763, p. 182–187, in Russian.
A method for identification of highly conserved elements and evolutionary analysis of superphylum Alveolata.
BMC Bioinformatics.
2016, vol. 17, art. 385, 16 pp.
DOI: 10.1186/s12859-016-1257-5, PMID: 27645252 Перейти к публикации
Высоко консервативные элементы в митохондриях однодольных растений.
Современные информационные технологии и ИТ-образование.
2016, том 12, № 2. стр. 211-215.
Ribosome reinitiation at leader peptides increases translation of bacterial proteins.
Biology Direct,
2016, vol. 11, art. 20.
DOI: 10.1186/s13062-016-0123-8, PMID: 27084079
(WoS Q1, IF 7) Перейти к публикации
Regulation of expression and evolution of genes in plastids of rhodophytic branch.
Life, 2016, vol. 6, art. 7.
DOI: 10.3390/life6010007, PMID: 26840333 Перейти к публикации
Широкомасштабный поиск потерь, приобретений и нарушений синтении генов у позвоночных животных.
Материалы VIII Московского Международного Конгресса «Биотехнология: состояние и перспективы развития», Москва, 17–20 марта 2015, часть 1, стр. 259–260. Перейти к публикации
A search for genes encoding histidine-containing leader peptides in Actinobacteria.
Proceedings of the 39th IITP RAS Interdisciplinary Conference & School “Information Technology and Systems 2015” (ITaS’15),
Sochi, Russia, Sep 7–11 2005, Moscow: IITP, 2015, P. 53–60. Перейти к публикации
A method of detecting local gene synteny rearrangement.
Proceedings of the International Moscow Conference on Computational Molecular Biology: MCCMB’15,
Moscow, July 16–19 2015, Moscow, IITP RAS, 2015, P. 249–252. Перейти к публикации
Ультраконсервативные элементы у простейших из надтипа Alveolata.
Современные информационные технологии и ИТ-образование,
2015, том 2, № 11, стр. 581–585.
О транскрипционных факторах, кодируемых в пластидах родофитной ветви.
Современные информационные технологии и ИТ-образование,
2015, том 2, № 11, стр. 571–575.
Классическая аттенюаторная регуляция, зависимая от концентрации триптофана, у актинобактерий.
Современные информационные технологии и ИТ-образование,
2015, том 2, № 11, стр. 565–568.
Comparative analysis of apicoplast-targeted protein extension lengths in Apicomplexan parasites.
BioMed Research International,
2015, Vol. 2015, Article ID 452958.
DOI: 10.1155/2015/452958, PMID: 26114107 Перейти к публикации
A database of plastid protein families from red algae and Apicomplexa and expression regulation of the moeB gene.
BioMed Research International,
2015, Vol. 2015, Article ID 510598.
DOI: 10.1155/2015/510598, PMID: 26114108 Перейти к публикации
